RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 DEPDC5O75140 1603 aa35.01■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.99■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 HRCP23327 699 aa34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 UNC13BO14795 1591 aa34.96■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
GTPBP1-212ENST00000488787 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.92■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 KANK1Q14678 1352 aa34.91■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.91■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.91■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.89■■■■□ 3.18
GTPBP1-212ENST00000488787 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 NUP155O75694 1391 aa34.87■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 MADDQ8WXG6 1647 aa34.86■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.86■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.86■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.85■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 TRIM52Q96A61 297 aa34.85■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 ABCC3O15438 1527 aa34.85■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.17
GTPBP1-212ENST00000488787 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.81■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.81■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP152O94986 1710 aa34.79■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 MROH2AA6NES4 1674 aa34.76■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 ZMYM3Q14202 1370 aa34.76■■■■□ 3.16
GTPBP1-212ENST00000488787 PZPP20742 1482 aa34.73■■■■□ 3.15
GTPBP1-212ENST00000488787 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.72■■■■□ 3.15
GTPBP1-212ENST00000488787 TET3O43151 1660 aa34.72■■■■□ 3.15
GTPBP1-212ENST00000488787 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.7■■■■□ 3.15
GTPBP1-212ENST00000488787 PTPRMP28827 1452 aa34.69■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.67■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.67■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 C3P01024 1663 aa34.66■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
GTPBP1-212ENST00000488787 NPATQ14207 1427 aa34.63■■■■□ 3.13
GTPBP1-212ENST00000488787 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
GTPBP1-212ENST00000488787 PKD2Q13563 968 aa34.61■■■■□ 3.13
GTPBP1-212ENST00000488787 E9PCH4 1651 aa34.6■■■■□ 3.13
GTPBP1-212ENST00000488787 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.55■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 ERVK-7P63135 1459 aa34.52■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.51■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.51■■■■□ 3.12
GTPBP1-212ENST00000488787 NOS1P29475 1434 aa34.5■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 PTPRTO14522 1441 aa34.47■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 FOXD1Q16676 465 aa34.47■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 TNRQ92752 1358 aa34.45■■■■□ 3.11
GTPBP1-212ENST00000488787 PLA2R1Q13018 1463 aa34.41■■■■□ 3.1
GTPBP1-212ENST00000488787 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.41■■■■□ 3.1
GTPBP1-212ENST00000488787 SYNMO15061 1565 aa34.4■■■■□ 3.1
GTPBP1-212ENST00000488787 TRPM2O94759 1503 aa34.36■■■■□ 3.09
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.36■■■■□ 3.09
GTPBP1-212ENST00000488787 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.36■■■■□ 3.09
GTPBP1-212ENST00000488787 NLRP1Q9C000 1473 aa34.33■■■■□ 3.09
GTPBP1-212ENST00000488787 IDI1Q13907 227 aa34.32■■■■□ 3.08
GTPBP1-212ENST00000488787 PIK3C2BO00750 1634 aa34.3■■■■□ 3.08
GTPBP1-212ENST00000488787 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.29■■■■□ 3.08
GTPBP1-212ENST00000488787 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.27■■■■□ 3.08
GTPBP1-212ENST00000488787 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.27■■■■□ 3.08
GTPBP1-212ENST00000488787 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.26■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 CLTCL1P53675 1640 aa34.25■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.24■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
GTPBP1-212ENST00000488787 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.15■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.15■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 ADGRB3O60242 1522 aa34.14■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.14■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.14■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF1BO60333 1816 aa34.14■■■■□ 3.06
GTPBP1-212ENST00000488787 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.13■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.09■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.08■■■■□ 3.05
GTPBP1-212ENST00000488787 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.07■■■■□ 3.04
GTPBP1-212ENST00000488787 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.06■■■■□ 3.04
GTPBP1-212ENST00000488787 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.02■■■■□ 3.04
GTPBP1-212ENST00000488787 NEUROD1Q13562 356 aa34.01■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 SLIT1O75093 1534 aa34■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 HSPA2P54652 639 aa34■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 RGL3Q3MIN7 710 aa33.99■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.99■■■■□ 3.03
GTPBP1-212ENST00000488787 ZFYVE9O95405 1425 aa33.95■■■■□ 3.02
GTPBP1-212ENST00000488787 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.95■■■■□ 3.02
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