RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 KIF15Q9NS87 1388 aa36.01■■■■□ 3.35
STRADB-209ENST00000488196 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.98■■■■□ 3.35
STRADB-209ENST00000488196 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.95■■■■□ 3.35
STRADB-209ENST00000488196 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.93■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.92■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.92■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 NPATQ14207 1427 aa35.91■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 PTPRKQ15262 1439 aa35.9■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 NCOA1Q15788 1441 aa35.89■■■■□ 3.34
STRADB-209ENST00000488196 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.88■■■■□ 3.33
STRADB-209ENST00000488196 ERBINQ96RT1 1412 aa35.86■■■■□ 3.33
STRADB-209ENST00000488196 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.86■■■■□ 3.33
STRADB-209ENST00000488196 ADGRL2O95490 1459 aa35.85■■■■□ 3.33
STRADB-209ENST00000488196 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
STRADB-209ENST00000488196 ABCC3O15438 1527 aa35.8■■■■□ 3.32
STRADB-209ENST00000488196 PZPP20742 1482 aa35.78■■■■□ 3.32
STRADB-209ENST00000488196 ITGAEP38570 1179 aa35.77■■■■□ 3.32
STRADB-209ENST00000488196 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.32
STRADB-209ENST00000488196 CEP152O94986 1710 aa35.76■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.75■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 DEPDC5O75140 1603 aa35.71■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 STRCQ7RTU9 1775 aa35.7■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 TNRQ92752 1358 aa35.7■■■■□ 3.31
STRADB-209ENST00000488196 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.67■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.67■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 ROCK1Q13464 1354 aa35.64■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 KANK1Q14678 1352 aa35.64■■■■□ 3.3
STRADB-209ENST00000488196 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.6■■■■□ 3.29
STRADB-209ENST00000488196 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.58■■■■□ 3.29
STRADB-209ENST00000488196 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.57■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 ERVK-7P63135 1459 aa35.57■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.54■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.54■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.52■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.52■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 NLRP1Q9C000 1473 aa35.51■■■■□ 3.28
STRADB-209ENST00000488196 PLA2R1Q13018 1463 aa35.48■■■■□ 3.27
STRADB-209ENST00000488196 PTPRTO14522 1441 aa35.46■■■■□ 3.27
STRADB-209ENST00000488196 UNC13BO14795 1591 aa35.45■■■■□ 3.27
STRADB-209ENST00000488196 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.43■■■■□ 3.26
STRADB-209ENST00000488196 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.42■■■■□ 3.26
STRADB-209ENST00000488196 PKD2Q13563 968 aa35.42■■■■□ 3.26
STRADB-209ENST00000488196 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
STRADB-209ENST00000488196 TET3O43151 1660 aa35.36■■■■□ 3.25
STRADB-209ENST00000488196 NUP155O75694 1391 aa35.34■■■■□ 3.25
STRADB-209ENST00000488196 NAIPQ13075 1403 aa35.32■■■■□ 3.25
STRADB-209ENST00000488196 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.32■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 NOS1P29475 1434 aa35.32■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.31■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 SYNMO15061 1565 aa35.31■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.31■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.3■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 IDI1Q13907 227 aa35.28■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 PIK3C2BO00750 1634 aa35.28■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.27■■■■□ 3.24
STRADB-209ENST00000488196 CERKQ8TCT0 537 aa35.25■■■■□ 3.23
STRADB-209ENST00000488196 E9PCH4 1651 aa35.24■■■■□ 3.23
STRADB-209ENST00000488196 HFM1A2PYH4 1435 aa35.23■■■■□ 3.23
STRADB-209ENST00000488196 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.22■■■■□ 3.23
STRADB-209ENST00000488196 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.18■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.17■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 FBXO41Q8TF61 875 aa35.15■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 MED14O60244 1454 aa35.15■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.15■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 LTKP29376 864 aa35.14■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 SLIT1O75093 1534 aa35.14■■■■□ 3.22
STRADB-209ENST00000488196 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.12■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.11■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 ADGRB3O60242 1522 aa35.11■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 TRIM52Q96A61 297 aa35.1■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 IQGAP1P46940 1657 aa35.09■■■■□ 3.21
STRADB-209ENST00000488196 EID1Q9Y6B2 187 aa35.07■■■■□ 3.2
STRADB-209ENST00000488196 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.06■■■■□ 3.2
STRADB-209ENST00000488196 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
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STRADB-209ENST00000488196 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.99■■■■□ 3.19
STRADB-209ENST00000488196 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
STRADB-209ENST00000488196 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.91■■■■□ 3.18
STRADB-209ENST00000488196 ZFYVE9O95405 1425 aa34.9■■■■□ 3.18
STRADB-209ENST00000488196 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
STRADB-209ENST00000488196 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.89■■■■□ 3.18
STRADB-209ENST00000488196 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.89■■■■□ 3.18
STRADB-209ENST00000488196 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.87■■■■□ 3.17
STRADB-209ENST00000488196 CPS1P31327 1500 aa34.87■■■■□ 3.17
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