RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488106.1

RHBDD3-205, Transcript of rhomboid domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene RHBDD3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3-205ENST00000488106 CEP152O94986 1710 aa36.48■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.47■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.47■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.47■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 ZMYM3Q14202 1370 aa36.46■■■■□ 3.43
RHBDD3-205ENST00000488106 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.44■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 ADGRL2O95490 1459 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 ERBINQ96RT1 1412 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.41■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 DEPDC5O75140 1603 aa36.39■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.39■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
RHBDD3-205ENST00000488106 NPATQ14207 1427 aa36.37■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 NCOA1Q15788 1441 aa36.37■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 HSPA2P54652 639 aa36.37■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 ABCC3O15438 1527 aa36.35■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.35■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 PTPRKQ15262 1439 aa36.34■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.34■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
RHBDD3-205ENST00000488106 PZPP20742 1482 aa36.28■■■■□ 3.4
RHBDD3-205ENST00000488106 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.39
RHBDD3-205ENST00000488106 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
RHBDD3-205ENST00000488106 ITGAEP38570 1179 aa36.25■■■■□ 3.39
RHBDD3-205ENST00000488106 STRCQ7RTU9 1775 aa36.25■■■■□ 3.39
RHBDD3-205ENST00000488106 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
RHBDD3-205ENST00000488106 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.18■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 ROCK1Q13464 1354 aa36.16■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.15■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 KANK1Q14678 1352 aa36.14■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 TNRQ92752 1358 aa36.14■■■■□ 3.38
RHBDD3-205ENST00000488106 UNC13BO14795 1591 aa36.13■■■■□ 3.37
RHBDD3-205ENST00000488106 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.12■■■■□ 3.37
RHBDD3-205ENST00000488106 ERVK-7P63135 1459 aa36.09■■■■□ 3.37
RHBDD3-205ENST00000488106 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.08■■■■□ 3.37
RHBDD3-205ENST00000488106 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.07■■■■□ 3.37
RHBDD3-205ENST00000488106 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.07■■■■□ 3.36
RHBDD3-205ENST00000488106 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.04■■■■□ 3.36
RHBDD3-205ENST00000488106 TET3O43151 1660 aa36.03■■■■□ 3.36
RHBDD3-205ENST00000488106 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
RHBDD3-205ENST00000488106 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.01■■■■□ 3.36
RHBDD3-205ENST00000488106 NLRP1Q9C000 1473 aa36■■■■□ 3.35
RHBDD3-205ENST00000488106 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.98■■■■□ 3.35
RHBDD3-205ENST00000488106 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.95■■■■□ 3.35
RHBDD3-205ENST00000488106 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.95■■■■□ 3.35
RHBDD3-205ENST00000488106 PLA2R1Q13018 1463 aa35.94■■■■□ 3.34
RHBDD3-205ENST00000488106 E9PCH4 1651 aa35.91■■■■□ 3.34
RHBDD3-205ENST00000488106 PIK3C2BO00750 1634 aa35.9■■■■□ 3.34
RHBDD3-205ENST00000488106 SYNMO15061 1565 aa35.89■■■■□ 3.34
RHBDD3-205ENST00000488106 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
RHBDD3-205ENST00000488106 NAIPQ13075 1403 aa35.85■■■■□ 3.33
RHBDD3-205ENST00000488106 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.85■■■■□ 3.33
RHBDD3-205ENST00000488106 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.84■■■■□ 3.33
RHBDD3-205ENST00000488106 PTPRTO14522 1441 aa35.83■■■■□ 3.33
RHBDD3-205ENST00000488106 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
RHBDD3-205ENST00000488106 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.81■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.81■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 NUP155O75694 1391 aa35.79■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 HFM1A2PYH4 1435 aa35.79■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 NOS1P29475 1434 aa35.78■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 PKD2Q13563 968 aa35.76■■■■□ 3.32
RHBDD3-205ENST00000488106 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
RHBDD3-205ENST00000488106 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.73■■■■□ 3.31
RHBDD3-205ENST00000488106 IQGAP1P46940 1657 aa35.72■■■■□ 3.31
RHBDD3-205ENST00000488106 ADGRB3O60242 1522 aa35.7■■■■□ 3.31
RHBDD3-205ENST00000488106 SLIT1O75093 1534 aa35.64■■■■□ 3.3
RHBDD3-205ENST00000488106 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.64■■■■□ 3.3
RHBDD3-205ENST00000488106 IDI1Q13907 227 aa35.63■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.63■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.61■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.6■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 MED14O60244 1454 aa35.6■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.59■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
RHBDD3-205ENST00000488106 TRIM52Q96A61 297 aa35.56■■■■□ 3.28
RHBDD3-205ENST00000488106 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.56■■■■□ 3.28
RHBDD3-205ENST00000488106 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.53■■■■□ 3.28
RHBDD3-205ENST00000488106 CERKQ8TCT0 537 aa35.53■■■■□ 3.28
RHBDD3-205ENST00000488106 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
RHBDD3-205ENST00000488106 KIF1BO60333 1816 aa35.48■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 CLTCL1P53675 1640 aa35.48■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 LTKP29376 864 aa35.47■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.47■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.46■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 TRPM2O94759 1503 aa35.46■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 EID1Q9Y6B2 187 aa35.45■■■■□ 3.27
RHBDD3-205ENST00000488106 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
RHBDD3-205ENST00000488106 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.42■■■■□ 3.26
RHBDD3-205ENST00000488106 FBXO41Q8TF61 875 aa35.41■■■■□ 3.26
RHBDD3-205ENST00000488106 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
RHBDD3-205ENST00000488106 ZFYVE9O95405 1425 aa35.38■■■■□ 3.25
RHBDD3-205ENST00000488106 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.37■■■■□ 3.25
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