RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.2■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 TNRQ92752 1358 aa23.19■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.17■■□□□ 1.3
STX4-209ENST00000486660 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.14■■□□□ 1.3
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STX4-209ENST00000486660 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
STX4-209ENST00000486660 DEPDC5O75140 1603 aa23.11■■□□□ 1.29
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STX4-209ENST00000486660 MED14O60244 1454 aa23.1■■□□□ 1.29
STX4-209ENST00000486660 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.1■■□□□ 1.29
STX4-209ENST00000486660 MBD5Q9P267 1494 aa23.09■■□□□ 1.29
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STX4-209ENST00000486660 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.05■■□□□ 1.28
STX4-209ENST00000486660 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.05■■□□□ 1.28
STX4-209ENST00000486660 NLRP1Q9C000 1473 aa23.05■■□□□ 1.28
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STX4-209ENST00000486660 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.03■■□□□ 1.28
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STX4-209ENST00000486660 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.94■■□□□ 1.26
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STX4-209ENST00000486660 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.92■■□□□ 1.26
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STX4-209ENST00000486660 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
STX4-209ENST00000486660 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.9■■□□□ 1.26
STX4-209ENST00000486660 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.9■■□□□ 1.26
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STX4-209ENST00000486660 ABCC3O15438 1527 aa22.87■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 ERVK-7P63135 1459 aa22.87■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 CEP162Q5TB80 1403 aa22.87■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 CEP152O94986 1710 aa22.84■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 NCOA2Q15596 1464 aa22.83■■□□□ 1.25
STX4-209ENST00000486660 LTKP29376 864 aa22.82■■□□□ 1.24
STX4-209ENST00000486660 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.8■■□□□ 1.24
STX4-209ENST00000486660 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.8■■□□□ 1.24
STX4-209ENST00000486660 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.8■■□□□ 1.24
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STX4-209ENST00000486660 SLIT1O75093 1534 aa22.77■■□□□ 1.24
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STX4-209ENST00000486660 PHLPP1O60346 1717 aa22.67■■□□□ 1.22
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STX4-209ENST00000486660 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.62■■□□□ 1.21
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STX4-209ENST00000486660 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.61■■□□□ 1.21
STX4-209ENST00000486660 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.61■■□□□ 1.21
STX4-209ENST00000486660 TET3O43151 1660 aa22.61■■□□□ 1.21
STX4-209ENST00000486660 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
STX4-209ENST00000486660 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.59■■□□□ 1.21
STX4-209ENST00000486660 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.58■■□□□ 1.21
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STX4-209ENST00000486660 NWD1Q149M9 1564 aa22.57■■□□□ 1.2
STX4-209ENST00000486660 LRP6O75581 1613 aa22.57■■□□□ 1.2
STX4-209ENST00000486660 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
STX4-209ENST00000486660 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.56■■□□□ 1.2
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STX4-209ENST00000486660 TRIM52Q96A61 297 aa22.53■■□□□ 1.2
STX4-209ENST00000486660 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.22e-6■■□□□ 13.3
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STX4-209ENST00000486660 KIF15Q9NS87 1388 aa22.5■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.48■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 ERBINQ96RT1 1412 aa22.48■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.47■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 ADGRB3O60242 1522 aa22.47■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.46■■□□□ 1.19
STX4-209ENST00000486660 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
STX4-209ENST00000486660 BCANQ96GW7 911 aa22.45■■□□□ 1.18
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