RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.22■■■■□ 3.07
NBPF3-212ENST00000486229 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
NBPF3-212ENST00000486229 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.21■■■■□ 3.07
NBPF3-212ENST00000486229 KIF3BO15066 747 aa34.2■■■■□ 3.07
NBPF3-212ENST00000486229 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.18■■■■□ 3.06
NBPF3-212ENST00000486229 NAIPQ13075 1403 aa34.15■■■■□ 3.06
NBPF3-212ENST00000486229 HSPA2P54652 639 aa34.14■■■■□ 3.06
NBPF3-212ENST00000486229 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.12■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 GGT6Q6P531 493 aa34.09■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 KANK1Q14678 1352 aa34.09■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 MLECQ14165 292 aa34.08■■■■□ 3.05
NBPF3-212ENST00000486229 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.07■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 DEPDC5O75140 1603 aa34.05■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 CERKQ8TCT0 537 aa34.05■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.04■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.02■■■■□ 3.04
NBPF3-212ENST00000486229 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 UNC13BO14795 1591 aa34■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.98■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 HRCP23327 699 aa33.97■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.97■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
NBPF3-212ENST00000486229 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.94■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 MROH2AA6NES4 1674 aa33.92■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 NUP155O75694 1391 aa33.9■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.9■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.9■■■■□ 3.02
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NBPF3-212ENST00000486229 TRIM52Q96A61 297 aa33.89■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.89■■■■□ 3.02
NBPF3-212ENST00000486229 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.87■■■■□ 3.01
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC3O15438 1527 aa33.87■■■■□ 3.01
NBPF3-212ENST00000486229 STRCQ7RTU9 1775 aa33.86■■■■□ 3.01
NBPF3-212ENST00000486229 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.86■■■■□ 3.01
NBPF3-212ENST00000486229 CEP152O94986 1710 aa33.84■■■■□ 3.01
NBPF3-212ENST00000486229 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.82■■■■□ 3
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NBPF3-212ENST00000486229 TET3O43151 1660 aa33.8■■■■□ 3
NBPF3-212ENST00000486229 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.8■■■■□ 3
NBPF3-212ENST00000486229 ZMYM3Q14202 1370 aa33.8■■■■□ 3
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.77■■■■□ 3
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NBPF3-212ENST00000486229 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
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NBPF3-212ENST00000486229 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.74■■■□□ 2.99
NBPF3-212ENST00000486229 PZPP20742 1482 aa33.73■■■□□ 2.99
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NBPF3-212ENST00000486229 NPATQ14207 1427 aa33.68■■■□□ 2.98
NBPF3-212ENST00000486229 SOCS7O14512 581 aa33.67■■■□□ 2.98
NBPF3-212ENST00000486229 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.67■■■□□ 2.98
NBPF3-212ENST00000486229 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.65■■■□□ 2.98
NBPF3-212ENST00000486229 E9PCH4 1651 aa33.62■■■□□ 2.97
NBPF3-212ENST00000486229 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.61■■■□□ 2.97
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NBPF3-212ENST00000486229 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.58■■■□□ 2.97
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NBPF3-212ENST00000486229 TNRQ92752 1358 aa33.54■■■□□ 2.96
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NBPF3-212ENST00000486229 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
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NBPF3-212ENST00000486229 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.5■■■□□ 2.95
NBPF3-212ENST00000486229 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.48■■■□□ 2.95
NBPF3-212ENST00000486229 NLRP1Q9C000 1473 aa33.48■■■□□ 2.95
NBPF3-212ENST00000486229 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.45■■■□□ 2.95
NBPF3-212ENST00000486229 TRPM2O94759 1503 aa33.43■■■□□ 2.94
NBPF3-212ENST00000486229 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.42■■■□□ 2.94
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NBPF3-212ENST00000486229 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.3■■■□□ 2.92
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NBPF3-212ENST00000486229 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.23■■■□□ 2.91
NBPF3-212ENST00000486229 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.22■■■□□ 2.91
NBPF3-212ENST00000486229 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
NBPF3-212ENST00000486229 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
NBPF3-212ENST00000486229 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.18■■■□□ 2.9
NBPF3-212ENST00000486229 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.17■■■□□ 2.9
NBPF3-212ENST00000486229 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
NBPF3-212ENST00000486229 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.12■■■□□ 2.89
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