RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 CNTLNQ9NXG0 1405 aa49.96■■■■■ 5.59
CHKB-210ENST00000484266 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP49.96■■■■■ 5.59
CHKB-210ENST00000484266 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
CHKB-210ENST00000484266 PPP6R1Q9UPN7 881 aa49.95■■■■■ 5.59
CHKB-210ENST00000484266 MROH1Q8NDA8 1641 aa49.95■■■■■ 5.59
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa49.92■■■■■ 5.58
CHKB-210ENST00000484266 MROH2AA6NES4 1674 aa49.92■■■■■ 5.58
CHKB-210ENST00000484266 FAM135AQ9P2D6 1515 aa49.9■■■■■ 5.58
CHKB-210ENST00000484266 DEPDC5O75140 1603 aa49.89■■■■■ 5.58
CHKB-210ENST00000484266 C3P01024 1663 aa49.87■■■■■ 5.57
CHKB-210ENST00000484266 KDM5DQ9BY66 1539 aa49.87■■■■■ 5.57
CHKB-210ENST00000484266 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP49.84■■■■■ 5.57
CHKB-210ENST00000484266 PLPPR3Q6T4P5 718 aa49.8■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP49.79■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa49.77■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 ZMYM3Q14202 1370 aa49.77■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 ABCC3O15438 1527 aa49.76■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 GCC2Q8IWJ2 1684 aa49.76■■■■■ 5.56
CHKB-210ENST00000484266 CEP152O94986 1710 aa49.74■■■■■ 5.55
CHKB-210ENST00000484266 NAIPQ13075 1403 aa49.72■■■■■ 5.55
CHKB-210ENST00000484266 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP49.68■■■■■ 5.549e-8■■■□□ 18
CHKB-210ENST00000484266 HFM1A2PYH4 1435 aa49.68■■■■■ 5.54
CHKB-210ENST00000484266 UNC13BO14795 1591 aa49.67■■■■■ 5.54
CHKB-210ENST00000484266 VWDEQ8N2E2 1590 aa49.67■■■■■ 5.54
CHKB-210ENST00000484266 KANK1Q14678 1352 aa49.63■■■■■ 5.54
CHKB-210ENST00000484266 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa49.62■■■■■ 5.53
CHKB-210ENST00000484266 PZPP20742 1482 aa49.58■■■■■ 5.53
CHKB-210ENST00000484266 LMTK2Q8IWU2 1503 aa49.56■■■■■ 5.52
CHKB-210ENST00000484266 NPATQ14207 1427 aa49.55■■■■■ 5.52
CHKB-210ENST00000484266 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
CHKB-210ENST00000484266 PREX1Q8TCU6 1659 aa49.51■■■■■ 5.52
CHKB-210ENST00000484266 IQGAP3Q86VI3 1631 aa49.46■■■■■ 5.51
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa49.45■■■■■ 5.51
CHKB-210ENST00000484266 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 LMTK3Q96Q04 1460 aa49.43■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 EFCAB6Q5THR3 1501 aa49.42■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 TET3O43151 1660 aa49.41■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 NUP155O75694 1391 aa49.41■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
CHKB-210ENST00000484266 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa49.36■■■■■ 5.49
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa49.36■■■■■ 5.49
CHKB-210ENST00000484266 MYO3AQ8NEV4 1616 aa49.35■■■■■ 5.49
CHKB-210ENST00000484266 ERVK-7P63135 1459 aa49.34■■■■■ 5.49
CHKB-210ENST00000484266 TNRQ92752 1358 aa49.32■■■■■ 5.49
CHKB-210ENST00000484266 SETD5Q9C0A6 1442 aa49.31■■■■■ 5.48
CHKB-210ENST00000484266 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.47
CHKB-210ENST00000484266 E9PCH4 1651 aa49.25■■■■■ 5.47
CHKB-210ENST00000484266 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP49.25■■■■■ 5.47
CHKB-210ENST00000484266 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
CHKB-210ENST00000484266 TRIM52Q96A61 297 aa49.18■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa49.16■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 HSPA2P54652 639 aa49.16■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 NOS1P29475 1434 aa49.15■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 NLRP1Q9C000 1473 aa49.14■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 A2ML1A8K2U0 1454 aa49.14■■■■■ 5.46
CHKB-210ENST00000484266 SYNMO15061 1565 aa49.12■■■■■ 5.45
CHKB-210ENST00000484266 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
CHKB-210ENST00000484266 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.01■■■■■ 5.44
CHKB-210ENST00000484266 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
CHKB-210ENST00000484266 UGGT1Q9NYU2 1555 aa48.98■■■■■ 5.43
CHKB-210ENST00000484266 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa48.96■■■■■ 5.43
CHKB-210ENST00000484266 PIK3C2BO00750 1634 aa48.96■■■■■ 5.43
CHKB-210ENST00000484266 UBR1Q8IWV7 1749 aa48.94■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 PKD2Q13563 968 aa48.93■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 HRCP23327 699 aa48.92■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 IDI1Q13907 227 aa48.91■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 PTPRTO14522 1441 aa48.9■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 STRCQ7RTU9 1775 aa48.9■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 SLC52A1Q9NWF4 448 aa48.89■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 MPHOSPH9Q99550 1183 aa48.88■■■■■ 5.42
CHKB-210ENST00000484266 PLA2R1Q13018 1463 aa48.86■■■■■ 5.41
CHKB-210ENST00000484266 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP48.85■■■■■ 5.41
CHKB-210ENST00000484266 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.83■■■■■ 5.41
CHKB-210ENST00000484266 TRPM2O94759 1503 aa48.8■■■■■ 5.4
CHKB-210ENST00000484266 ADGRB3O60242 1522 aa48.8■■■■■ 5.4
CHKB-210ENST00000484266 FOXD1Q16676 465 aa48.75■■■■■ 5.4
CHKB-210ENST00000484266 MYO5BQ9ULV0 1848 aa48.73■■■■■ 5.39
CHKB-210ENST00000484266 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-210ENST00000484266 STAG3Q9UJ98 1225 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-210ENST00000484266 CLTCL1P53675 1640 aa48.71■■■■■ 5.39
CHKB-210ENST00000484266 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
CHKB-210ENST00000484266 SLIT1O75093 1534 aa48.68■■■■■ 5.38
CHKB-210ENST00000484266 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa48.67■■■■■ 5.38
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP23Q9P227 1491 aa48.66■■■■■ 5.38
CHKB-210ENST00000484266 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.62■■■■■ 5.37
CHKB-210ENST00000484266 TMEM2Q9UHN6 1383 aa48.61■■■■■ 5.37
CHKB-210ENST00000484266 ANKLE2Q86XL3 938 aa48.59■■■■■ 5.37
CHKB-210ENST00000484266 CHGAP10645 457 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
CHKB-210ENST00000484266 KIF1BO60333 1816 aa48.56■■■■■ 5.36
CHKB-210ENST00000484266 DMRT2Q9Y5R5 561 aa48.56■■■■■ 5.36
CHKB-210ENST00000484266 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
CHKB-210ENST00000484266 MED14O60244 1454 aa48.5■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 LTKP29376 864 aa48.49■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 CCDC144AA2RUR9 1427 aa48.48■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 TXNDC2Q86VQ3 553 aa48.48■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 ZFYVE9O95405 1425 aa48.47■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 EID1Q9Y6B2 187 aa48.45■■■■■ 5.35
CHKB-210ENST00000484266 IQGAP1P46940 1657 aa48.44■■■■■ 5.34
CHKB-210ENST00000484266 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP48.43■■■■■ 5.34
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