RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-208ENST00000483868 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
TPRA1-208ENST00000483868 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.21■■■■■ 4.19
TPRA1-208ENST00000483868 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
TPRA1-208ENST00000483868 DEPDC5O75140 1603 aa41.19■■■■■ 4.18
TPRA1-208ENST00000483868 UNC13BO14795 1591 aa41.16■■■■■ 4.18
TPRA1-208ENST00000483868 TRIM52Q96A61 297 aa41.15■■■■■ 4.18
TPRA1-208ENST00000483868 HRCP23327 699 aa41.14■■■■■ 4.18
TPRA1-208ENST00000483868 NUP155O75694 1391 aa41.12■■■■■ 4.17
TPRA1-208ENST00000483868 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
TPRA1-208ENST00000483868 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.05■■■■■ 4.16
TPRA1-208ENST00000483868 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.02■■■■■ 4.16
TPRA1-208ENST00000483868 PZPP20742 1482 aa41.01■■■■■ 4.16
TPRA1-208ENST00000483868 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.01■■■■■ 4.16
TPRA1-208ENST00000483868 KANK1Q14678 1352 aa41.01■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 CEP152O94986 1710 aa40.98■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 ABCC3O15438 1527 aa40.98■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.96■■■■■ 4.15
TPRA1-208ENST00000483868 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 MADDQ8WXG6 1647 aa40.9■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.9■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.89■■■■■ 4.14
TPRA1-208ENST00000483868 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 FOXD1Q16676 465 aa40.84■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 TET3O43151 1660 aa40.84■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 PKD2Q13563 968 aa40.84■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.83■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
TPRA1-208ENST00000483868 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.81■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 ZMYM3Q14202 1370 aa40.8■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.8■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.8■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 NPATQ14207 1427 aa40.78■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 E9PCH4 1651 aa40.78■■■■■ 4.12
TPRA1-208ENST00000483868 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 MROH2AA6NES4 1674 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
TPRA1-208ENST00000483868 C3P01024 1663 aa40.68■■■■■ 4.1
TPRA1-208ENST00000483868 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TPRA1-208ENST00000483868 PTPRMP28827 1452 aa40.63■■■■■ 4.09
TPRA1-208ENST00000483868 PLA2R1Q13018 1463 aa40.61■■■■■ 4.09
TPRA1-208ENST00000483868 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.58■■■■■ 4.09
TPRA1-208ENST00000483868 ERVK-7P63135 1459 aa40.58■■■■■ 4.09
TPRA1-208ENST00000483868 NOS1P29475 1434 aa40.57■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.56■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 PTPRTO14522 1441 aa40.56■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.53■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.53■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 SYNMO15061 1565 aa40.51■■■■■ 4.08
TPRA1-208ENST00000483868 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.48■■■■■ 4.07
TPRA1-208ENST00000483868 TRPM2O94759 1503 aa40.46■■■■■ 4.07
TPRA1-208ENST00000483868 TNRQ92752 1358 aa40.44■■■■■ 4.06
TPRA1-208ENST00000483868 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.42■■■■■ 4.06
TPRA1-208ENST00000483868 CLTCL1P53675 1640 aa40.39■■■■■ 4.06
TPRA1-208ENST00000483868 IDI1Q13907 227 aa40.39■■■■■ 4.06
TPRA1-208ENST00000483868 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.37■■■■■ 4.05
TPRA1-208ENST00000483868 PIK3C2BO00750 1634 aa40.35■■■■■ 4.05
TPRA1-208ENST00000483868 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.33■■■■■ 4.05
TPRA1-208ENST00000483868 NEUROD1Q13562 356 aa40.31■■■■■ 4.04
TPRA1-208ENST00000483868 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
TPRA1-208ENST00000483868 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.28■■■■■ 4.04
TPRA1-208ENST00000483868 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.26■■■■■ 4.04
TPRA1-208ENST00000483868 NLRP1Q9C000 1473 aa40.24■■■■■ 4.03
TPRA1-208ENST00000483868 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
TPRA1-208ENST00000483868 KIF1BO60333 1816 aa40.17■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.17■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.17■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 RGL3Q3MIN7 710 aa40.16■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.15■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.15■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.14■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.14■■■■■ 4.02
TPRA1-208ENST00000483868 ADGRB3O60242 1522 aa40.13■■■■■ 4.01
TPRA1-208ENST00000483868 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.12■■■■■ 4.01
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
TPRA1-208ENST00000483868 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
TPRA1-208ENST00000483868 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.01■■■■■ 4
TPRA1-208ENST00000483868 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.01■■■■■ 4
TPRA1-208ENST00000483868 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.01■■■■■ 4
TPRA1-208ENST00000483868 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
TPRA1-208ENST00000483868 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
TPRA1-208ENST00000483868 TONSLQ96HA7 1378 aa39.97■■■■□ 3.99
TPRA1-208ENST00000483868 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.96■■■■□ 3.99
TPRA1-208ENST00000483868 HSPA2P54652 639 aa39.95■■■■□ 3.99
TPRA1-208ENST00000483868 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.94■■■■□ 3.98
TPRA1-208ENST00000483868 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.93■■■■□ 3.98
TPRA1-208ENST00000483868 ZFYVE9O95405 1425 aa39.92■■■■□ 3.98
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