RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	HSPA2	P54652	639 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDGF-208	ENST00000482651	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	GGT6	Q6P531	493 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	NPAT	Q14207	1427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	C3	P01024	1663 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	KIF3B	O15066	747 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDGF-208	ENST00000482651	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	ABCC5	O15440	1437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	DAPK1	P53355	1430 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDGF-208	ENST00000482651	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	PZP	P20742	1482 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	PTPRT	O14522	1441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	TNR	Q92752	1358 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	ABCC3	O15438	1527 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDGF-208	ENST00000482651	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	PKD2	Q13563	968 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	MSH5	O43196	834 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	KANK1	Q14678	1352 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDGF-208	ENST00000482651	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26	6e-11	■■□□□ 14.4
HDGF-208	ENST00000482651	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27	2e-6	■■□□□ 12.6
HDGF-208	ENST00000482651	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	CEP152	O94986	1710 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDGF-208	ENST00000482651	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	MED14	O60244	1454 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	ITGAE	P38570	1179 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	NOS1	P29475	1434 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HDGF-208	ENST00000482651	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms