RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.88■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 DAPK1P53355 1430 aa35.88■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.86■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.83■■■■□ 3.33
PSME4-208ENST00000481518 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.81■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.81■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 KIF15Q9NS87 1388 aa35.8■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 PZPP20742 1482 aa35.78■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 NCOA1Q15788 1441 aa35.76■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
PSME4-208ENST00000481518 ABCC3O15438 1527 aa35.75■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.75■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.75■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 ERBINQ96RT1 1412 aa35.71■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.7■■■■□ 3.31
PSME4-208ENST00000481518 TNRQ92752 1358 aa35.69■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.69■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.67■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 PTPRTO14522 1441 aa35.66■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 CEP152O94986 1710 aa35.66■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.65■■■■□ 3.3
PSME4-208ENST00000481518 ADGRL2O95490 1459 aa35.63■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 DEPDC5O75140 1603 aa35.62■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 PLA2R1Q13018 1463 aa35.61■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 FBXO41Q8TF61 875 aa35.59■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.58■■■■□ 3.29
PSME4-208ENST00000481518 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.57■■■■□ 3.28
PSME4-208ENST00000481518 ERVK-7P63135 1459 aa35.54■■■■□ 3.28
PSME4-208ENST00000481518 CERKQ8TCT0 537 aa35.54■■■■□ 3.28
PSME4-208ENST00000481518 NLRP1Q9C000 1473 aa35.53■■■■□ 3.28
PSME4-208ENST00000481518 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.52■■■■□ 3.286e-6■□□□□ 10.7
PSME4-208ENST00000481518 PKD2Q13563 968 aa35.48■■■■□ 3.27
PSME4-208ENST00000481518 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.47■■■■□ 3.27
PSME4-208ENST00000481518 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.47■■■■□ 3.27
PSME4-208ENST00000481518 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.45■■■■□ 3.27
PSME4-208ENST00000481518 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.45■■■■□ 3.27
PSME4-208ENST00000481518 KANK1Q14678 1352 aa35.44■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.43■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.42■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.264e-14■■□□□ 11.9
PSME4-208ENST00000481518 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.41■■■■□ 3.26
PSME4-208ENST00000481518 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PSME4-208ENST00000481518 ROCK1Q13464 1354 aa35.35■■■■□ 3.25
PSME4-208ENST00000481518 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PSME4-208ENST00000481518 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.33■■■■□ 3.25
PSME4-208ENST00000481518 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.32■■■■□ 3.25
PSME4-208ENST00000481518 ITGAEP38570 1179 aa35.31■■■■□ 3.24
PSME4-208ENST00000481518 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.29■■■■□ 3.24
PSME4-208ENST00000481518 UNC13BO14795 1591 aa35.28■■■■□ 3.24
PSME4-208ENST00000481518 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
PSME4-208ENST00000481518 SYNMO15061 1565 aa35.25■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 PIK3C2BO00750 1634 aa35.24■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 MED14O60244 1454 aa35.24■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 NOS1P29475 1434 aa35.22■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 TET3O43151 1660 aa35.21■■■■□ 3.23
PSME4-208ENST00000481518 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.19■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 IQGAP1P46940 1657 aa35.17■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.17■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 SLIT1O75093 1534 aa35.16■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 IDI1Q13907 227 aa35.15■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.14■■■■□ 3.22
PSME4-208ENST00000481518 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
PSME4-208ENST00000481518 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.13■■■■□ 3.21
PSME4-208ENST00000481518 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
PSME4-208ENST00000481518 LTKP29376 864 aa35.1■■■■□ 3.21
PSME4-208ENST00000481518 E9PCH4 1651 aa35.08■■■■□ 3.21
PSME4-208ENST00000481518 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.07■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 ADGRB3O60242 1522 aa35.06■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 NUP155O75694 1391 aa35.05■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.05■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.05■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 CPS1P31327 1500 aa35.05■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.02■■■■□ 3.2
PSME4-208ENST00000481518 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.99■■■■□ 3.19
PSME4-208ENST00000481518 NAIPQ13075 1403 aa34.98■■■■□ 3.19
PSME4-208ENST00000481518 EID1Q9Y6B2 187 aa34.98■■■■□ 3.19
PSME4-208ENST00000481518 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.93■■■■□ 3.18
PSME4-208ENST00000481518 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.93■■■■□ 3.18
PSME4-208ENST00000481518 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.92■■■■□ 3.18
PSME4-208ENST00000481518 HFM1A2PYH4 1435 aa34.89■■■■□ 3.18
PSME4-208ENST00000481518 ZFYVE9O95405 1425 aa34.87■■■■□ 3.17
PSME4-208ENST00000481518 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.86■■■■□ 3.17
PSME4-208ENST00000481518 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.81■■■■□ 3.16
PSME4-208ENST00000481518 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.81■■■■□ 3.16
PSME4-208ENST00000481518 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PSME4-208ENST00000481518 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.78■■■■□ 3.16
PSME4-208ENST00000481518 ALKQ9UM73 1620 aa34.77■■■■□ 3.16
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