RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 PTPRKQ15262 1439 aa32.15■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.14■■■□□ 2.744e-28■■□□□ 12.2
ACTB-211ENST00000480301 ADGRL2O95490 1459 aa32.14■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 ERBINQ96RT1 1412 aa32.12■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.11■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.09■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.08■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 NPATQ14207 1427 aa32.08■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
ACTB-211ENST00000480301 HSPA2P54652 639 aa32.06■■■□□ 2.72
ACTB-211ENST00000480301 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.05■■■□□ 2.72
ACTB-211ENST00000480301 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.04■■■□□ 2.72
ACTB-211ENST00000480301 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.03■■■□□ 2.72
ACTB-211ENST00000480301 ITGAEP38570 1179 aa32.02■■■□□ 2.72
ACTB-211ENST00000480301 ROCK1Q13464 1354 aa32■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 ABCC3O15438 1527 aa32■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.97■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 PZPP20742 1482 aa31.97■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.95■■■□□ 2.71
ACTB-211ENST00000480301 DEPDC5O75140 1603 aa31.93■■■□□ 2.7
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
ACTB-211ENST00000480301 KANK1Q14678 1352 aa31.88■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 CEP152O94986 1710 aa31.87■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 TNRQ92752 1358 aa31.87■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.83■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.83■■■□□ 2.69
ACTB-211ENST00000480301 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.81■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-7P63135 1459 aa31.78■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.78■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.78■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
ACTB-211ENST00000480301 STRCQ7RTU9 1775 aa31.73■■■□□ 2.67
ACTB-211ENST00000480301 UNC13BO14795 1591 aa31.73■■■□□ 2.67
ACTB-211ENST00000480301 NLRP1Q9C000 1473 aa31.72■■■□□ 2.67
ACTB-211ENST00000480301 NAIPQ13075 1403 aa31.7■■■□□ 2.67
ACTB-211ENST00000480301 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.68■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.67■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 NUP155O75694 1391 aa31.66■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 PLA2R1Q13018 1463 aa31.65■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.65■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 HFM1A2PYH4 1435 aa31.64■■■□□ 2.66
ACTB-211ENST00000480301 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.62■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 TET3O43151 1660 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 PTPRTO14522 1441 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 NOS1P29475 1434 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 PKD2Q13563 968 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.6■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.59■■■□□ 2.65
ACTB-211ENST00000480301 IDI1Q13907 227 aa31.54■■■□□ 2.64
ACTB-211ENST00000480301 SYNMO15061 1565 aa31.54■■■□□ 2.64
ACTB-211ENST00000480301 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.51■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.5■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 E9PCH4 1651 aa31.49■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.49■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 PIK3C2BO00750 1634 aa31.47■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 TRIM52Q96A61 297 aa31.45■■■□□ 2.63
ACTB-211ENST00000480301 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.44■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.43■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.41■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 MED14O60244 1454 aa31.4■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 SLIT1O75093 1534 aa31.39■■■□□ 2.62
ACTB-211ENST00000480301 LTKP29376 864 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 ADGRB3O60242 1522 aa31.36■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.36■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.34■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 CERKQ8TCT0 537 aa31.34■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
ACTB-211ENST00000480301 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.31■■■□□ 2.6
ACTB-211ENST00000480301 EID1Q9Y6B2 187 aa31.31■■■□□ 2.6
ACTB-211ENST00000480301 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
ACTB-211ENST00000480301 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.27■■■□□ 2.6
ACTB-211ENST00000480301 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.26■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 IQGAP1P46940 1657 aa31.25■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.23■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.23■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE9O95405 1425 aa31.22■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.21■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 TRPM2O94759 1503 aa31.2■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.2■■■□□ 2.59
ACTB-211ENST00000480301 FBXO41Q8TF61 875 aa31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms