RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.73■■■■■ 4.75
HOXB3-208ENST00000476342 PTPRMP28827 1452 aa44.71■■■■■ 4.75
HOXB3-208ENST00000476342 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.7■■■■■ 4.75
HOXB3-208ENST00000476342 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
HOXB3-208ENST00000476342 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.67■■■■■ 4.74
HOXB3-208ENST00000476342 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
HOXB3-208ENST00000476342 DEPDC5O75140 1603 aa44.62■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 MROH2AA6NES4 1674 aa44.62■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.61■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.61■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.59■■■■■ 4.73
HOXB3-208ENST00000476342 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
HOXB3-208ENST00000476342 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.56■■■■■ 4.72
HOXB3-208ENST00000476342 HFM1A2PYH4 1435 aa44.54■■■■■ 4.72
HOXB3-208ENST00000476342 NAIPQ13075 1403 aa44.53■■■■■ 4.72
HOXB3-208ENST00000476342 C3P01024 1663 aa44.52■■■■■ 4.72
HOXB3-208ENST00000476342 KANK1Q14678 1352 aa44.5■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 ABCC3O15438 1527 aa44.48■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 ZMYM3Q14202 1370 aa44.48■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.48■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 CEP152O94986 1710 aa44.46■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 UNC13BO14795 1591 aa44.46■■■■■ 4.71
HOXB3-208ENST00000476342 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
HOXB3-208ENST00000476342 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.41■■■■■ 4.7
HOXB3-208ENST00000476342 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.37■■■■■ 4.69
HOXB3-208ENST00000476342 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.34■■■■■ 4.69
HOXB3-208ENST00000476342 PZPP20742 1482 aa44.32■■■■■ 4.69
HOXB3-208ENST00000476342 NPATQ14207 1427 aa44.29■■■■■ 4.68
HOXB3-208ENST00000476342 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
HOXB3-208ENST00000476342 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.28■■■■■ 4.68
HOXB3-208ENST00000476342 NUP155O75694 1391 aa44.26■■■■■ 4.68
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.25■■■■■ 4.67
HOXB3-208ENST00000476342 SETD5Q9C0A6 1442 aa44.24■■■■■ 4.67
HOXB3-208ENST00000476342 TET3O43151 1660 aa44.23■■■■■ 4.67
HOXB3-208ENST00000476342 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.22■■■■■ 4.67
HOXB3-208ENST00000476342 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.21■■■■■ 4.67
HOXB3-208ENST00000476342 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
HOXB3-208ENST00000476342 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
HOXB3-208ENST00000476342 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.13■■■■■ 4.66
HOXB3-208ENST00000476342 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM52Q96A61 297 aa44.13■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.13■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 ERVK-7P63135 1459 aa44.12■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 TNRQ92752 1358 aa44.1■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.08■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa44.08■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.07■■■■■ 4.65
HOXB3-208ENST00000476342 E9PCH4 1651 aa44.04■■■■■ 4.64
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
HOXB3-208ENST00000476342 NLRP1Q9C000 1473 aa43.97■■■■■ 4.63
HOXB3-208ENST00000476342 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
HOXB3-208ENST00000476342 NOS1P29475 1434 aa43.94■■■■■ 4.62
HOXB3-208ENST00000476342 HRCP23327 699 aa43.93■■■■■ 4.62
HOXB3-208ENST00000476342 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
HOXB3-208ENST00000476342 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.91■■■■■ 4.62
HOXB3-208ENST00000476342 SYNMO15061 1565 aa43.89■■■■■ 4.62
HOXB3-208ENST00000476342 PKD2Q13563 968 aa43.83■■■■■ 4.61
HOXB3-208ENST00000476342 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.83■■■■■ 4.61
HOXB3-208ENST00000476342 HSPA2P54652 639 aa43.82■■■■■ 4.6
HOXB3-208ENST00000476342 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.82■■■■■ 4.6
HOXB3-208ENST00000476342 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.81■■■■■ 4.6
HOXB3-208ENST00000476342 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.79■■■■■ 4.6
HOXB3-208ENST00000476342 PTPRTO14522 1441 aa43.76■■■■■ 4.6
HOXB3-208ENST00000476342 PIK3C2BO00750 1634 aa43.75■■■■■ 4.59
HOXB3-208ENST00000476342 IDI1Q13907 227 aa43.73■■■■■ 4.59
HOXB3-208ENST00000476342 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.72■■■■■ 4.59
HOXB3-208ENST00000476342 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
HOXB3-208ENST00000476342 TRPM2O94759 1503 aa43.7■■■■■ 4.59
HOXB3-208ENST00000476342 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
HOXB3-208ENST00000476342 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.67■■■■■ 4.58
HOXB3-208ENST00000476342 PLA2R1Q13018 1463 aa43.67■■■■■ 4.58
HOXB3-208ENST00000476342 ADGRB3O60242 1522 aa43.65■■■■■ 4.58
HOXB3-208ENST00000476342 FOXD1Q16676 465 aa43.63■■■■■ 4.57
HOXB3-208ENST00000476342 STRCQ7RTU9 1775 aa43.57■■■■■ 4.57
HOXB3-208ENST00000476342 CLTCL1P53675 1640 aa43.57■■■■■ 4.56
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.55■■■■■ 4.56
HOXB3-208ENST00000476342 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.52■■■■■ 4.56
HOXB3-208ENST00000476342 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
HOXB3-208ENST00000476342 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
HOXB3-208ENST00000476342 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.5■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 SLIT1O75093 1534 aa43.5■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 KIF1BO60333 1816 aa43.49■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.48■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.48■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.47■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.47■■■■■ 4.55
HOXB3-208ENST00000476342 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.44■■■■■ 4.54
HOXB3-208ENST00000476342 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.43■■■■■ 4.54
HOXB3-208ENST00000476342 EID1Q9Y6B2 187 aa43.4■■■■■ 4.54
HOXB3-208ENST00000476342 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.37■■■■■ 4.53
HOXB3-208ENST00000476342 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.36■■■■■ 4.53
HOXB3-208ENST00000476342 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.35■■■■■ 4.53
HOXB3-208ENST00000476342 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
HOXB3-208ENST00000476342 MED14O60244 1454 aa43.33■■■■■ 4.53
HOXB3-208ENST00000476342 RIMS2Q9UQ26 1411 aa43.33■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms