RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473280.1

SYTL1-202, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene SYTL1, Length 312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-202ENST00000473280 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-202ENST00000473280 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.44■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 PIP4K2BP78356 416 aa22.43■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 PZPP20742 1482 aa22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 TOM1O60784 492 aa22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 TNRQ92752 1358 aa22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.4■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.4■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.4■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 DEPDC5O75140 1603 aa22.39■■□□□ 1.18
SYTL1-202ENST00000473280 MED14O60244 1454 aa22.38■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.37■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.35■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 IQGAP1P46940 1657 aa22.34■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.33■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 KIF3BO15066 747 aa22.33■■□□□ 1.17
SYTL1-202ENST00000473280 NLRP1Q9C000 1473 aa22.33■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 MIA2Q96PC5 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.32■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 CEP162Q5TB80 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.3■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.29■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 SYNMO15061 1565 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-202ENST00000473280 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYTL1-202ENST00000473280 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-202ENST00000473280 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYTL1-202ENST00000473280 ABCC3O15438 1527 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-202ENST00000473280 NCOA2Q15596 1464 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-202ENST00000473280 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.19■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.19■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 ERVK-7P63135 1459 aa22.17■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 CEP152O94986 1710 aa22.16■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-202ENST00000473280 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.11■■□□□ 1.13
SYTL1-202ENST00000473280 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYTL1-202ENST00000473280 SLIT1O75093 1534 aa22.1■■□□□ 1.13
SYTL1-202ENST00000473280 TSPY4P0CV99 314 aa22.07■■□□□ 1.12
SYTL1-202ENST00000473280 TSPY10P0CW01 314 aa22.07■■□□□ 1.12
SYTL1-202ENST00000473280 LTKP29376 864 aa22.07■■□□□ 1.12
SYTL1-202ENST00000473280 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.02■■□□□ 1.12
SYTL1-202ENST00000473280 PIK3C2BO00750 1634 aa22.01■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 POTEAQ6S8J7 498 aa21.99■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.98■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.98■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 MAP3K1Q13233 1512 aa21.97■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYTL1-202ENST00000473280 TET3O43151 1660 aa21.94■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 TMEM94Q12767 1356 aa21.93■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.93■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.92■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 EID1Q9Y6B2 187 aa21.9■■□□□ 1.1
SYTL1-202ENST00000473280 NWD1Q149M9 1564 aa21.89■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.89■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.89■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 ERBINQ96RT1 1412 aa21.88■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 KCNA6P17658 529 aa21.87■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 KIF15Q9NS87 1388 aa21.87■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 PHLPP1O60346 1717 aa21.85■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.84■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.84■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 ABCC5O15440 1437 aa21.83■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 IDI1Q13907 227 aa21.83■■□□□ 1.09
SYTL1-202ENST00000473280 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.82■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 ADGRB3O60242 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.79■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 NOS1P29475 1434 aa21.79■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.78■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.77■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.77■■□□□ 1.08
SYTL1-202ENST00000473280 JCADQ9P266 1359 aa21.75■■□□□ 1.07
SYTL1-202ENST00000473280 DAPK1P53355 1430 aa21.74■■□□□ 1.07
SYTL1-202ENST00000473280 LRP6O75581 1613 aa21.74■■□□□ 1.07
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