RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 ZMYM3Q14202 1370 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.59■■□□□ 1.85
CLDN11-202ENST00000468358 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 HSPA2P54652 639 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 ERBINQ96RT1 1412 aa26.53■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.53■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 ITGAEP38570 1179 aa26.52■■□□□ 1.84
CLDN11-202ENST00000468358 NCOA1Q15788 1441 aa26.51■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 ADGRL2O95490 1459 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 NPATQ14207 1427 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 PTPRKQ15262 1439 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 CEP152O94986 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
CLDN11-202ENST00000468358 ABCC3O15438 1527 aa26.44■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 PZPP20742 1482 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 KANK1Q14678 1352 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 DEPDC5O75140 1603 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN11-202ENST00000468358 ROCK1Q13464 1354 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN11-202ENST00000468358 TNRQ92752 1358 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN11-202ENST00000468358 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CLDN11-202ENST00000468358 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CLDN11-202ENST00000468358 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN11-202ENST00000468358 STRCQ7RTU9 1775 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN11-202ENST00000468358 ERVK-7P63135 1459 aa26.27■■□□□ 1.8
CLDN11-202ENST00000468358 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 UNC13BO14795 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 NLRP1Q9C000 1473 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.2■■□□□ 1.79
CLDN11-202ENST00000468358 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 PLA2R1Q13018 1463 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 TET3O43151 1660 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 NUP155O75694 1391 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN11-202ENST00000468358 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.14■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 PTPRTO14522 1441 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 NAIPQ13075 1403 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 PKD2Q13563 968 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 HFM1A2PYH4 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN11-202ENST00000468358 SYNMO15061 1565 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 PIK3C2BO00750 1634 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 E9PCH4 1651 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 NOS1P29475 1434 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 IDI1Q13907 227 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 TRIM52Q96A61 297 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN11-202ENST00000468358 NEURL4Q96JN8 1562 aa26■■□□□ 1.75
CLDN11-202ENST00000468358 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN11-202ENST00000468358 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLDN11-202ENST00000468358 ADGRB3O60242 1522 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN11-202ENST00000468358 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 CERKQ8TCT0 537 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 EID1Q9Y6B2 187 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 IQGAP1P46940 1657 aa25.93■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 SLIT1O75093 1534 aa25.93■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.92■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.92■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 MED14O60244 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CLDN11-202ENST00000468358 LTKP29376 864 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.86■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 FBXO41Q8TF61 875 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN11-202ENST00000468358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 BCANQ96GW7 911 aa25.81■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 TRPM2O94759 1503 aa25.79■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms