RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 PZPP20742 1482 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-202ENST00000466964 PIP4K2BP78356 416 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-202ENST00000466964 MBD5Q9P267 1494 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-202ENST00000466964 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-202ENST00000466964 TNRQ92752 1358 aa17.15■□□□□ 0.34
LAMC1-202ENST00000466964 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.14■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 GGT6Q6P531 493 aa17.14■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 SYNMO15061 1565 aa17.14■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
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LAMC1-202ENST00000466964 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 NLRP1Q9C000 1473 aa17.12■□□□□ 0.33
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LAMC1-202ENST00000466964 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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LAMC1-202ENST00000466964 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 MIA2Q96PC5 1412 aa17.09■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.09■□□□□ 0.33
LAMC1-202ENST00000466964 TIAM1Q13009 1591 aa17.08■□□□□ 0.32
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LAMC1-202ENST00000466964 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
LAMC1-202ENST00000466964 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
LAMC1-202ENST00000466964 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.04■□□□□ 0.32
LAMC1-202ENST00000466964 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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LAMC1-202ENST00000466964 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 CEP162Q5TB80 1403 aa16.97■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 KIF3BO15066 747 aa16.97■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.96■□□□□ 0.31
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LAMC1-202ENST00000466964 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.96■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 NCOA2Q15596 1464 aa16.96■□□□□ 0.31
LAMC1-202ENST00000466964 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.96■□□□□ 0.3
LAMC1-202ENST00000466964 SLIT1O75093 1534 aa16.96■□□□□ 0.3
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LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.94■□□□□ 0.3
LAMC1-202ENST00000466964 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.93■□□□□ 0.3
LAMC1-202ENST00000466964 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.93■□□□□ 0.3
LAMC1-202ENST00000466964 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
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LAMC1-202ENST00000466964 MAP3K1Q13233 1512 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-202ENST00000466964 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.89■□□□□ 0.29
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LAMC1-202ENST00000466964 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-202ENST00000466964 CEP152O94986 1710 aa16.84■□□□□ 0.29
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.84■□□□□ 0.29
LAMC1-202ENST00000466964 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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LAMC1-202ENST00000466964 NWD1Q149M9 1564 aa16.81■□□□□ 0.28
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LAMC1-202ENST00000466964 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM94Q12767 1356 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 PIK3C2BO00750 1634 aa16.79■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.77■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
LAMC1-202ENST00000466964 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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LAMC1-202ENST00000466964 PHLPP1O60346 1717 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 KCNA6P17658 529 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.73■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 LRP6O75581 1613 aa16.73■□□□□ 0.27
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LAMC1-202ENST00000466964 TSPY10P0CW01 314 aa16.72■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
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LAMC1-202ENST00000466964 JCADQ9P266 1359 aa16.72■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.71■□□□□ 0.27
LAMC1-202ENST00000466964 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.7■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.7■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 EID1Q9Y6B2 187 aa16.68■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 SHPRHQ149N8 1683 aa16.67■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 ERBINQ96RT1 1412 aa16.67■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 NOS1P29475 1434 aa16.66■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 ADGRB3O60242 1522 aa16.65■□□□□ 0.26
LAMC1-202ENST00000466964 SLAIN2Q9P270 581 aa16.64■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.64■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.64■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 DIP2AQ14689 1571 aa16.64■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.63■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 MSH6P52701 1360 aa16.63■□□□□ 0.25
LAMC1-202ENST00000466964 ZFYVE9O95405 1425 aa16.62■□□□□ 0.25
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