RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-211ENST00000464833 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.97■■■■■ 4.31
CHRD-211ENST00000464833 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.97■■■■■ 4.31
CHRD-211ENST00000464833 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.96■■■■■ 4.31
CHRD-211ENST00000464833 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.94■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.93■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 MROH2AA6NES4 1674 aa41.93■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 DEPDC5O75140 1603 aa41.91■■■■■ 4.3
CHRD-211ENST00000464833 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
CHRD-211ENST00000464833 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.88■■■■■ 4.29
CHRD-211ENST00000464833 C3P01024 1663 aa41.87■■■■■ 4.29
CHRD-211ENST00000464833 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.79■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 ABCC3O15438 1527 aa41.79■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 ZMYM3Q14202 1370 aa41.79■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.79■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 NAIPQ13075 1403 aa41.77■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 HFM1A2PYH4 1435 aa41.76■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 CEP152O94986 1710 aa41.76■■■■■ 4.28
CHRD-211ENST00000464833 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.75■■■■■ 4.27
CHRD-211ENST00000464833 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.75■■■■■ 4.27
CHRD-211ENST00000464833 UNC13BO14795 1591 aa41.73■■■■■ 4.27
CHRD-211ENST00000464833 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.271e-8■□□□□ 11.1
CHRD-211ENST00000464833 KANK1Q14678 1352 aa41.68■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.67■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.65■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 PZPP20742 1482 aa41.65■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 NPATQ14207 1427 aa41.64■■■■■ 4.26
CHRD-211ENST00000464833 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.56■■■■■ 4.24
CHRD-211ENST00000464833 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.56■■■■■ 4.24
CHRD-211ENST00000464833 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.56■■■■■ 4.24
CHRD-211ENST00000464833 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.52■■■■■ 4.24
CHRD-211ENST00000464833 TET3O43151 1660 aa41.51■■■■■ 4.24
CHRD-211ENST00000464833 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.51■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 NUP155O75694 1391 aa41.49■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.46■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 ERVK-7P63135 1459 aa41.46■■■■■ 4.23
CHRD-211ENST00000464833 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.44■■■■■ 4.22
CHRD-211ENST00000464833 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.43■■■■■ 4.22
CHRD-211ENST00000464833 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.43■■■■■ 4.22
CHRD-211ENST00000464833 TNRQ92752 1358 aa41.42■■■■■ 4.22
CHRD-211ENST00000464833 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
CHRD-211ENST00000464833 E9PCH4 1651 aa41.36■■■■■ 4.21
CHRD-211ENST00000464833 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
CHRD-211ENST00000464833 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 NOS1P29475 1434 aa41.3■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.29■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 TRIM52Q96A61 297 aa41.29■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 NLRP1Q9C000 1473 aa41.29■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.27■■■■■ 4.2
CHRD-211ENST00000464833 SYNMO15061 1565 aa41.25■■■■■ 4.19
CHRD-211ENST00000464833 HSPA2P54652 639 aa41.24■■■■■ 4.19
CHRD-211ENST00000464833 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
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CHRD-211ENST00000464833 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CHRD-211ENST00000464833 HRCP23327 699 aa41.14■■■■■ 4.18
CHRD-211ENST00000464833 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.12■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.12■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 PIK3C2BO00750 1634 aa41.1■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 PKD2Q13563 968 aa41.1■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 PTPRTO14522 1441 aa41.09■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.09■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 IDI1Q13907 227 aa41.07■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.07■■■■■ 4.17
CHRD-211ENST00000464833 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.06■■■■■ 4.16
CHRD-211ENST00000464833 STRCQ7RTU9 1775 aa41.05■■■■■ 4.16
CHRD-211ENST00000464833 PLA2R1Q13018 1463 aa41.05■■■■■ 4.16
CHRD-211ENST00000464833 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CHRD-211ENST00000464833 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CHRD-211ENST00000464833 TRPM2O94759 1503 aa41■■■■■ 4.15
CHRD-211ENST00000464833 ADGRB3O60242 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
CHRD-211ENST00000464833 FOXD1Q16676 465 aa40.93■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.92■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 CLTCL1P53675 1640 aa40.91■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.91■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 SLIT1O75093 1534 aa40.89■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.89■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.89■■■■■ 4.14
CHRD-211ENST00000464833 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.85■■■■■ 4.13
CHRD-211ENST00000464833 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.83■■■■■ 4.13
CHRD-211ENST00000464833 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.83■■■■■ 4.13
CHRD-211ENST00000464833 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.81■■■■■ 4.12
CHRD-211ENST00000464833 KIF1BO60333 1816 aa40.77■■■■■ 4.12
CHRD-211ENST00000464833 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.77■■■■■ 4.12
CHRD-211ENST00000464833 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CHRD-211ENST00000464833 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CHRD-211ENST00000464833 MED14O60244 1454 aa40.74■■■■■ 4.11
CHRD-211ENST00000464833 ZFYVE9O95405 1425 aa40.72■■■■■ 4.11
CHRD-211ENST00000464833 LTKP29376 864 aa40.72■■■■■ 4.11
CHRD-211ENST00000464833 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.72■■■■■ 4.11
CHRD-211ENST00000464833 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.69■■■■■ 4.11
CHRD-211ENST00000464833 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.69■■■■■ 4.1
CHRD-211ENST00000464833 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.68■■■■■ 4.1
CHRD-211ENST00000464833 EID1Q9Y6B2 187 aa40.67■■■■■ 4.1
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