RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PLCH2O75038 1416 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE6P0CI01 402 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 DEPDC5O75140 1603 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 KIF15Q9NS87 1388 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 TONSLQ96HA7 1378 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 NEUROD1Q13562 356 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 ASXL2Q76L83 1435 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 ERBINQ96RT1 1412 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 ATP10AO60312 1499 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 GABBR2O75899 941 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-210ENST00000462363 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2R1Q13018 1463 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 MIER1Q8N108 512 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 KDM5CP41229 1560 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM52Q96A61 297 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 ATP7AQ04656 1500 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 FANCAO15360 1455 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 TSPY4P0CV99 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 TSPY10P0CW01 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 NUP155O75694 1391 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 E9PCH4 1651 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 TET3O43151 1660 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 GLI2P10070 1586 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 PKD2Q13563 968 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRL1O94910 1474 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 KCNH8Q96L42 1107 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 LAMC1P11047 1609 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-210ENST00000462363 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 RICTORQ6R327 1708 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 TRPM2O94759 1503 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 CEP152O94986 1710 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRTO14522 1441 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 NEO1Q92859 1461 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA6Q8N139 1617 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 A2MP01023 1474 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 CLTCL1P53675 1640 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 AFAP1Q8N556 730 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 DIP2BQ9P265 1576 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.4 ms