RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461758.6

TLE4-213, Transcript of transducin like enhancer of split 4, human

TSL 5

Gene TLE4, Length 1,536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE4-213	ENST00000461758	NAIP	Q13075	1403 aa		41.2	■■■■■ 4.19
TLE4-213	ENST00000461758	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
TLE4-213	ENST00000461758	GGT6	Q6P531	493 aa		41.15	■■■■■ 4.18
TLE4-213	ENST00000461758	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.12	■■■■■ 4.17
TLE4-213	ENST00000461758	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.08	■■■■■ 4.17
TLE4-213	ENST00000461758	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.08	■■■■■ 4.17
TLE4-213	ENST00000461758	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.05	■■■■■ 4.16
TLE4-213	ENST00000461758	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	41.02	■■■■■ 4.16
TLE4-213	ENST00000461758	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.02	■■■■■ 4.16
TLE4-213	ENST00000461758	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.15
TLE4-213	ENST00000461758	KANK1	Q14678	1352 aa		41	■■■■■ 4.15
TLE4-213	ENST00000461758	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TLE4-213	ENST00000461758	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.95	■■■■■ 4.15
TLE4-213	ENST00000461758	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	HRC	P23327	699 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.91	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	NUP155	O75694	1391 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.89	■■■■■ 4.14
TLE4-213	ENST00000461758	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TLE4-213	ENST00000461758	UNC13B	O14795	1591 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TLE4-213	ENST00000461758	C3	P01024	1663 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TLE4-213	ENST00000461758	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.85	■■■■■ 4.13
TLE4-213	ENST00000461758	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.81	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC3	O15438	1527 aa		40.78	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.78	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TLE4-213	ENST00000461758	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.74	■■■■■ 4.11
TLE4-213	ENST00000461758	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TLE4-213	ENST00000461758	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TLE4-213	ENST00000461758	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TLE4-213	ENST00000461758	CEP152	O94986	1710 aa		40.71	■■■■■ 4.11
TLE4-213	ENST00000461758	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
TLE4-213	ENST00000461758	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
TLE4-213	ENST00000461758	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.63	■■■■■ 4.1
TLE4-213	ENST00000461758	TET3	O43151	1660 aa		40.63	■■■■■ 4.09
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.63	■■■■■ 4.09
TLE4-213	ENST00000461758	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		40.62	■■■■■ 4.09
TLE4-213	ENST00000461758	PZP	P20742	1482 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TLE4-213	ENST00000461758	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TLE4-213	ENST00000461758	PKD2	Q13563	968 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TLE4-213	ENST00000461758	NPAT	Q14207	1427 aa		40.55	■■■■■ 4.08
TLE4-213	ENST00000461758	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
TLE4-213	ENST00000461758	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.5	■■■■■ 4.07
TLE4-213	ENST00000461758	HSPA2	P54652	639 aa		40.5	■■■■■ 4.07
TLE4-213	ENST00000461758	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
TLE4-213	ENST00000461758		E9PCH4	1651 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TLE4-213	ENST00000461758	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
TLE4-213	ENST00000461758	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TLE4-213	ENST00000461758	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TLE4-213	ENST00000461758	TNR	Q92752	1358 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TLE4-213	ENST00000461758	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TLE4-213	ENST00000461758	FOXD1	Q16676	465 aa		40.37	■■■■■ 4.05
TLE4-213	ENST00000461758	NOS1	P29475	1434 aa		40.37	■■■■■ 4.05
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
TLE4-213	ENST00000461758	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.32	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	PTPRT	O14522	1441 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.3	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
TLE4-213	ENST00000461758	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.25	■■■■■ 4.03
TLE4-213	ENST00000461758	SYNM	O15061	1565 aa		40.22	■■■■■ 4.03
TLE4-213	ENST00000461758	IDI1	Q13907	227 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TLE4-213	ENST00000461758	TRPM2	O94759	1503 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TLE4-213	ENST00000461758	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.2	■■■■■ 4.03
TLE4-213	ENST00000461758	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.18	■■■■■ 4.02
TLE4-213	ENST00000461758	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		40.17	■■■■■ 4.02
TLE4-213	ENST00000461758	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TLE4-213	ENST00000461758	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.13	■■■■■ 4.01
TLE4-213	ENST00000461758	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TLE4-213	ENST00000461758	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.09	■■■■■ 4.01
TLE4-213	ENST00000461758	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
TLE4-213	ENST00000461758	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
TLE4-213	ENST00000461758	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.05	■■■■■ 4
TLE4-213	ENST00000461758	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
TLE4-213	ENST00000461758	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		39.98	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.98	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	KIF1B	O60333	1816 aa		39.97	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	39.96	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		39.95	■■■■□ 3.99
TLE4-213	ENST00000461758	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	39.93	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		39.9	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		39.89	■■■■□ 3.98
TLE4-213	ENST00000461758	NEUROD1	Q13562	356 aa		39.88	■■■■□ 3.97
TLE4-213	ENST00000461758	RGL3	Q3MIN7	710 aa		39.87	■■■■□ 3.97
TLE4-213	ENST00000461758	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		39.86	■■■■□ 3.97
TLE4-213	ENST00000461758	EID1	Q9Y6B2	187 aa		39.86	■■■■□ 3.97
TLE4-213	ENST00000461758	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		39.85	■■■■□ 3.97
TLE4-213	ENST00000461758	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		39.84	■■■■□ 3.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms