RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNA4P22459 653 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GGT6Q6P531 493 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPY4P0CV99 314 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPY10P0CW01 314 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DAPK1P53355 1430 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 MROH2AA6NES4 1674 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF3BO15066 747 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA2P54652 639 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF39Q9H2S5 420 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRKQ15262 1439 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMYM3Q14202 1370 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP152O94986 1710 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 STRCQ7RTU9 1775 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF15Q9NS87 1388 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NCOA1Q15788 1441 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRL2O95490 1459 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 DEPDC5O75140 1603 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC3O15438 1527 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGAEP38570 1179 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 NPATQ14207 1427 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ERBINQ96RT1 1412 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 16.8
RABGEF1-206ENST00000461017 PZPP20742 1482 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TNRQ92752 1358 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVK-7P63135 1459 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ROCK1Q13464 1354 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC13BO14795 1591 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-206ENST00000461017 E9PCH4 1651 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNMO15061 1565 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 NAIPQ13075 1403 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 TET3O43151 1660 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3C2BO00750 1634 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 KANK1Q14678 1352 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2R1Q13018 1463 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP1Q9C000 1473 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRTO14522 1441 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 NOS1P29475 1434 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IDI1Q13907 227 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP155O75694 1391 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 LTKP29376 864 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 PKD2Q13563 968 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 HFM1A2PYH4 1435 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 CERKQ8TCT0 537 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SLIT1O75093 1534 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-206ENST00000461017 MED14O60244 1454 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms