RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460726.2

RASA4DP-201, Transcript of RAS p21 protein activator 4CD, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RASA4DP, Length 1,199 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4DP-201ENST00000460726 NCOA1Q15788 1441 aa28.35■■■□□ 2.13
RASA4DP-201ENST00000460726 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
RASA4DP-201ENST00000460726 ADGRL2O95490 1459 aa28.34■■■□□ 2.13
RASA4DP-201ENST00000460726 ZMYM3Q14202 1370 aa28.33■■■□□ 2.13
RASA4DP-201ENST00000460726 ERBINQ96RT1 1412 aa28.32■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 PTPRKQ15262 1439 aa28.31■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.31■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.29■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.28■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.27■■■□□ 2.12
RASA4DP-201ENST00000460726 HSPA2P54652 639 aa28.26■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 ITGAEP38570 1179 aa28.25■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.24■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 NPATQ14207 1427 aa28.22■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 ROCK1Q13464 1354 aa28.21■■■□□ 2.11
RASA4DP-201ENST00000460726 ABCC3O15438 1527 aa28.19■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.18■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 DEPDC5O75140 1603 aa28.18■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.18■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 PZPP20742 1482 aa28.15■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
RASA4DP-201ENST00000460726 CEP152O94986 1710 aa28.12■■■□□ 2.09
RASA4DP-201ENST00000460726 KANK1Q14678 1352 aa28.11■■■□□ 2.09
RASA4DP-201ENST00000460726 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
RASA4DP-201ENST00000460726 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.08■■■□□ 2.09
RASA4DP-201ENST00000460726 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.06■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 TNRQ92752 1358 aa28.04■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.02■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.01■■■□□ 2.08
RASA4DP-201ENST00000460726 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 UNC13BO14795 1591 aa28■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.99■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 STRCQ7RTU9 1775 aa27.99■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 ERVK-7P63135 1459 aa27.99■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.96■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 NAIPQ13075 1403 aa27.95■■■□□ 2.07
RASA4DP-201ENST00000460726 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.94■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 NLRP1Q9C000 1473 aa27.94■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.93■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 HFM1A2PYH4 1435 aa27.92■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 TET3O43151 1660 aa27.9■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 NUP155O75694 1391 aa27.89■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.89■■■□□ 2.06
RASA4DP-201ENST00000460726 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.89■■■□□ 2.05
RASA4DP-201ENST00000460726 PLA2R1Q13018 1463 aa27.85■■■□□ 2.05
RASA4DP-201ENST00000460726 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
RASA4DP-201ENST00000460726 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.84■■■□□ 2.05
RASA4DP-201ENST00000460726 NOS1P29475 1434 aa27.83■■■□□ 2.05
RASA4DP-201ENST00000460726 FBXO41Q8TF61 875 aa27.82■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 SYNMO15061 1565 aa27.8■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.79■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 PKD2Q13563 968 aa27.79■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 E9PCH4 1651 aa27.78■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 PTPRTO14522 1441 aa27.77■■■□□ 2.04
RASA4DP-201ENST00000460726 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.75■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 CERKQ8TCT0 537 aa27.75■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 IDI1Q13907 227 aa27.74■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 PIK3C2BO00750 1634 aa27.74■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 TRIM52Q96A61 297 aa27.73■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.73■■■□□ 2.03
RASA4DP-201ENST00000460726 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.7■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.69■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.67■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.66■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 ADGRB3O60242 1522 aa27.65■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 SLIT1O75093 1534 aa27.64■■■□□ 2.02
RASA4DP-201ENST00000460726 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.64■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.61■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 MED14O60244 1454 aa27.61■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.61■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 LTKP29376 864 aa27.58■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.58■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
RASA4DP-201ENST00000460726 EID1Q9Y6B2 187 aa27.57■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.57■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.56■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.56■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 IQGAP1P46940 1657 aa27.55■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.54■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 TRPM2O94759 1503 aa27.53■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.52■■■□□ 2
RASA4DP-201ENST00000460726 CLTCL1P53675 1640 aa27.49■■□□□ 1.99
RASA4DP-201ENST00000460726 FOXD1Q16676 465 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms