RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 ITGAEP38570 1179 aa34.08■■■■□ 3.05
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C9orf3-209ENST00000460573 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.07■■■■□ 3.04
C9orf3-209ENST00000460573 ROCK1Q13464 1354 aa34.07■■■■□ 3.04
C9orf3-209ENST00000460573 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.06■■■■□ 3.04
C9orf3-209ENST00000460573 GGT6Q6P531 493 aa34.01■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 ERBINQ96RT1 1412 aa33.99■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 MROH2AA6NES4 1674 aa33.97■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 KIF3BO15066 747 aa33.97■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.95■■■■□ 3.03
C9orf3-209ENST00000460573 ZMYM3Q14202 1370 aa33.9■■■■□ 3.02
C9orf3-209ENST00000460573 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.89■■■■□ 3.02
C9orf3-209ENST00000460573 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.86■■■■□ 3.01
C9orf3-209ENST00000460573 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
C9orf3-209ENST00000460573 NPATQ14207 1427 aa33.83■■■■□ 3.01
C9orf3-209ENST00000460573 FBXO41Q8TF61 875 aa33.83■■■■□ 3.01
C9orf3-209ENST00000460573 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.83■■■■□ 3.01
C9orf3-209ENST00000460573 HFM1A2PYH4 1435 aa33.8■■■■□ 3
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C9orf3-209ENST00000460573 STRCQ7RTU9 1775 aa33.77■■■■□ 3
C9orf3-209ENST00000460573 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.76■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 DEPDC5O75140 1603 aa33.75■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.73■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 KANK1Q14678 1352 aa33.72■■■□□ 2.99
C9orf3-209ENST00000460573 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.71■■■□□ 2.99
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C9orf3-209ENST00000460573 ABCC3O15438 1527 aa33.65■■■□□ 2.98
C9orf3-209ENST00000460573 UNC13BO14795 1591 aa33.64■■■□□ 2.98
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
C9orf3-209ENST00000460573 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.64■■■□□ 2.98
C9orf3-209ENST00000460573 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
C9orf3-209ENST00000460573 PTPRTO14522 1441 aa33.62■■■□□ 2.97
C9orf3-209ENST00000460573 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
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C9orf3-209ENST00000460573 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.6■■■□□ 2.97
C9orf3-209ENST00000460573 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.59■■■□□ 2.97
C9orf3-209ENST00000460573 CEP152O94986 1710 aa33.56■■■□□ 2.96
C9orf3-209ENST00000460573 NUP155O75694 1391 aa33.56■■■□□ 2.96
C9orf3-209ENST00000460573 PZPP20742 1482 aa33.56■■■□□ 2.96
C9orf3-209ENST00000460573 TNRQ92752 1358 aa33.55■■■□□ 2.96
C9orf3-209ENST00000460573 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.53■■■□□ 2.96
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C9orf3-209ENST00000460573 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.52■■■□□ 2.96
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C9orf3-209ENST00000460573 PKD2Q13563 968 aa33.5■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 PLA2R1Q13018 1463 aa33.5■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 TRIM52Q96A61 297 aa33.47■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 TET3O43151 1660 aa33.46■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 HRCP23327 699 aa33.46■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.45■■■□□ 2.95
C9orf3-209ENST00000460573 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.45■■■□□ 2.94
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C9orf3-209ENST00000460573 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
C9orf3-209ENST00000460573 NLRP1Q9C000 1473 aa33.38■■■□□ 2.93
C9orf3-209ENST00000460573 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.38■■■□□ 2.93
C9orf3-209ENST00000460573 ERVK-7P63135 1459 aa33.37■■■□□ 2.93
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C9orf3-209ENST00000460573 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
C9orf3-209ENST00000460573 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.34■■■□□ 2.93
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C9orf3-209ENST00000460573 E9PCH4 1651 aa33.31■■■□□ 2.92
C9orf3-209ENST00000460573 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.31■■■□□ 2.92
C9orf3-209ENST00000460573 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.3■■■□□ 2.92
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
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C9orf3-209ENST00000460573 SYNMO15061 1565 aa33.18■■■□□ 2.9
C9orf3-209ENST00000460573 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.18■■■□□ 2.9
C9orf3-209ENST00000460573 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.16■■■□□ 2.9
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C9orf3-209ENST00000460573 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.14■■■□□ 2.89
C9orf3-209ENST00000460573 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.12■■■□□ 2.89
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C9orf3-209ENST00000460573 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.1■■■□□ 2.89
C9orf3-209ENST00000460573 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.1■■■□□ 2.89
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C9orf3-209ENST00000460573 FOXD1Q16676 465 aa33.06■■■□□ 2.88
C9orf3-209ENST00000460573 EID1Q9Y6B2 187 aa33.04■■■□□ 2.88
C9orf3-209ENST00000460573 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
C9orf3-209ENST00000460573 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33■■■□□ 2.87
C9orf3-209ENST00000460573 ADGRB3O60242 1522 aa33■■■□□ 2.87
C9orf3-209ENST00000460573 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
C9orf3-209ENST00000460573 CLTCL1P53675 1640 aa32.96■■■□□ 2.87
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