RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460237.2

RPS4XP19-201, Transcript of ribosomal protein S4X pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RPS4XP19, Length 736 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP19-201ENST00000460237 C3P01024 1663 aa11.66□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.66□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 PREX2Q70Z35 1606 aa11.66□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.66□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.65□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.65□□□□□ -0.54
RPS4XP19-201ENST00000460237 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.65□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 A2MP01023 1474 aa11.63□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 PTPRKQ15262 1439 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 KIF3BO15066 747 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 ATP7AQ04656 1500 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS4XP19-201ENST00000460237 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 PLA2R1Q13018 1463 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 TOM1O60784 492 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 TSPY4P0CV99 314 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 TSPY10P0CW01 314 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 MROH2AA6NES4 1674 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 PIP4K2BP78356 416 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 MBD5Q9P267 1494 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 SPDYE6P0CI01 402 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 PLXNC1O60486 1568 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 TNRQ92752 1358 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 HSPA1LP34931 641 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 CEP162Q5TB80 1403 aa11.52□□□□□ -0.56
RPS4XP19-201ENST00000460237 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 MIA2Q96PC5 1412 aa11.51□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.5□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.48□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 TIAM1Q13009 1591 aa11.48□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.48□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.48□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.47□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.47□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 PZPP20742 1482 aa11.46□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 NCOA2Q15596 1464 aa11.46□□□□□ -0.57
RPS4XP19-201ENST00000460237 CPS1P31327 1500 aa11.45□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.45□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 NLRP1Q9C000 1473 aa11.44□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.44□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.44□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.44□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.43□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.42□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.42□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 MED14O60244 1454 aa11.42□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 PITPNM1O00562 1244 aa11.41□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 LTKP29376 864 aa11.4□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 EID1Q9Y6B2 187 aa11.4□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.4□□□□□ -0.58
RPS4XP19-201ENST00000460237 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.39□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.38□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.38□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.38□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.37□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 ABCC3O15438 1527 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 DEPDC5O75140 1603 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 ERVK-7P63135 1459 aa11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 IDI1Q13907 227 aa11.34□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.34□□□□□ -0.59
RPS4XP19-201ENST00000460237 KANK1Q14678 1352 aa11.32□□□□□ -0.6
RPS4XP19-201ENST00000460237 KIF15Q9NS87 1388 aa11.32□□□□□ -0.6
RPS4XP19-201ENST00000460237 KCNA6P17658 529 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms