RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.36■■■■□ 3.57
PPP1CB-208ENST00000455580 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.33■■■■□ 3.57
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 NCOA1Q15788 1441 aa37.32■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 DAPK1P53355 1430 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRTO14522 1441 aa37.3■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 PZPP20742 1482 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF15Q9NS87 1388 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 CERKQ8TCT0 537 aa37.26■■■■□ 3.56
PPP1CB-208ENST00000455580 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 TNRQ92752 1358 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.2■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.2■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.2■■■■□ 3.55
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC3O15438 1527 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 PLA2R1Q13018 1463 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 ERBINQ96RT1 1412 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 PKD2Q13563 968 aa37.17■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.17■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.17■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
PPP1CB-208ENST00000455580 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
PPP1CB-208ENST00000455580 NLRP1Q9C000 1473 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.522e-7■■■■□ 21.4
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRL2O95490 1459 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.03■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP152O94986 1710 aa37.02■■■■□ 3.52
PPP1CB-208ENST00000455580 ERVK-7P63135 1459 aa37.01■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 KANK1Q14678 1352 aa36.98■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 DEPDC5O75140 1603 aa36.98■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP1CB-208ENST00000455580 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.96■■■■□ 3.512e-7■■■□□ 17.8
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.94■■■■□ 3.5
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.89■■■■□ 3.5
PPP1CB-208ENST00000455580 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.88■■■■□ 3.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.87■■■■□ 3.49
PPP1CB-208ENST00000455580 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.84■■■■□ 3.49
PPP1CB-208ENST00000455580 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ROCK1Q13464 1354 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP1CB-208ENST00000455580 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP1CB-208ENST00000455580 MED14O60244 1454 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP1CB-208ENST00000455580 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ITGAEP38570 1179 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP1CB-208ENST00000455580 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP1CB-208ENST00000455580 IDI1Q13907 227 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP1CB-208ENST00000455580 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.7■■■■□ 3.47
PPP1CB-208ENST00000455580 NOS1P29475 1434 aa36.69■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 LTKP29376 864 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 SLIT1O75093 1534 aa36.64■■■■□ 3.46
PPP1CB-208ENST00000455580 PIK3C2BO00750 1634 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 SYNMO15061 1565 aa36.62■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 IQGAP1P46940 1657 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 UNC13BO14795 1591 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 EID1Q9Y6B2 187 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 CPS1P31327 1500 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 TET3O43151 1660 aa36.58■■■■□ 3.45
PPP1CB-208ENST00000455580 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.56■■■■□ 3.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP155O75694 1391 aa36.53■■■■□ 3.44
PPP1CB-208ENST00000455580 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP1CB-208ENST00000455580 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.47■■■■□ 3.43
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRB3O60242 1522 aa36.46■■■■□ 3.43
PPP1CB-208ENST00000455580 E9PCH4 1651 aa36.42■■■■□ 3.42
PPP1CB-208ENST00000455580 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.4■■■■□ 3.42
PPP1CB-208ENST00000455580 TOM1O60784 492 aa36.39■■■■□ 3.42
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP1CB-208ENST00000455580 NAIPQ13075 1403 aa36.36■■■■□ 3.41
PPP1CB-208ENST00000455580 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PPP1CB-208ENST00000455580 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.32■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.31■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 ZFYVE9O95405 1425 aa36.31■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 PIP4K2BP78356 416 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.27■■■■□ 3.4
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