RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPRKQ15262 1439 aa17.26■□□□□ 0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZMYM3Q14202 1370 aa17.26■□□□□ 0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIF15Q9NS87 1388 aa17.26■□□□□ 0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MROH2AA6NES4 1674 aa17.26■□□□□ 0.35
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GGT6Q6P531 493 aa17.25■□□□□ 0.35
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.23■□□□□ 0.35
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.21■□□□□ 0.35
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C3P01024 1663 aa17.21■□□□□ 0.35
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MROH1Q8NDA8 1641 aa17.2■□□□□ 0.34
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.15■□□□□ 0.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PZPP20742 1482 aa17.14■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCC3O15438 1527 aa17.14■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.14■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.13■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.13■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMTK2Q8IWU2 1503 aa17.12■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KANK1Q14678 1352 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAIPQ13075 1403 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNC13BO14795 1591 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGAEP38570 1179 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPA2P54652 639 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNRQ92752 1358 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HFM1A2PYH4 1435 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK-7P63135 1459 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRP1Q9C000 1473 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP152O94986 1710 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17■□□□□ 0.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOS1P29475 1434 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2R1Q13018 1463 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STRCQ7RTU9 1775 aa16.97■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.96■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TET3O43151 1660 aa16.96■□□□□ 0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.95■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP155O75694 1391 aa16.95■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPRTO14522 1441 aa16.94■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKD2Q13563 968 aa16.93■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.93■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IDI1Q13907 227 aa16.9■□□□□ 0.3
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E9PCH4 1651 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MED14O60244 1454 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLIT1O75093 1534 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HRCP23327 699 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIK3C2BO00750 1634 aa16.85■□□□□ 0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.82■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.81■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LTKP29376 864 aa16.8■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRB3O60242 1522 aa16.79■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.78■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM52Q96A61 297 aa16.78■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.77■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFYVE9O95405 1425 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPM2O94759 1503 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.74■□□□□ 0.27
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