RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453129.2

CLDN25-201, Transcript of claudin 25, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN25, Length 754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25-201ENST00000453129 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLDN25-201ENST00000453129 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.58■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.58■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 NCOA1Q15788 1441 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 PTPRKQ15262 1439 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 ADGRL2O95490 1459 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 ERBINQ96RT1 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 ITGAEP38570 1179 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 HSPA2P54652 639 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN25-201ENST00000453129 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 NPATQ14207 1427 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 CEP152O94986 1710 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 ABCC3O15438 1527 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 DEPDC5O75140 1603 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
CLDN25-201ENST00000453129 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 ROCK1Q13464 1354 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 PZPP20742 1482 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN25-201ENST00000453129 KANK1Q14678 1352 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 TNRQ92752 1358 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 STRCQ7RTU9 1775 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN25-201ENST00000453129 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.33■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.33■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 ERVK-7P63135 1459 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 UNC13BO14795 1591 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 NLRP1Q9C000 1473 aa20.29■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.28■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.27■□□□□ 0.84
CLDN25-201ENST00000453129 NAIPQ13075 1403 aa20.27■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 TET3O43151 1660 aa20.26■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.25■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.25■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.25■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 NUP155O75694 1391 aa20.24■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.24■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 PLA2R1Q13018 1463 aa20.23■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 HFM1A2PYH4 1435 aa20.22■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 E9PCH4 1651 aa20.21■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.21■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 SYNMO15061 1565 aa20.21■□□□□ 0.83
CLDN25-201ENST00000453129 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 PTPRTO14522 1441 aa20.19■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 NOS1P29475 1434 aa20.19■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 PKD2Q13563 968 aa20.19■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 PIK3C2BO00750 1634 aa20.19■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 IDI1Q13907 227 aa20.17■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.15■□□□□ 0.82
CLDN25-201ENST00000453129 TRIM52Q96A61 297 aa20.13■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.13■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN25-201ENST00000453129 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 ADGRB3O60242 1522 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 SLIT1O75093 1534 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 MED14O60244 1454 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 LTKP29376 864 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 CERKQ8TCT0 537 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 IQGAP1P46940 1657 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.04■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.03■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 EID1Q9Y6B2 187 aa20.03■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CLDN25-201ENST00000453129 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.97■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 CLTCL1P53675 1640 aa19.97■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 TRPM2O94759 1503 aa19.97■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 FOXD1Q16676 465 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.96■□□□□ 0.79
CLDN25-201ENST00000453129 ZFYVE9O95405 1425 aa19.95■□□□□ 0.78
CLDN25-201ENST00000453129 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms