RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.75■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 ROCK1Q13464 1354 aa16.73■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 ERBINQ96RT1 1412 aa16.72■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.273e-9■■■□□ 17.2
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.71■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 C3P01024 1663 aa16.71■□□□□ 0.27
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP152O94986 1710 aa16.69■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 NAIPQ13075 1403 aa16.68■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 DEPDC5O75140 1603 aa16.67■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ZMYM3Q14202 1370 aa16.67■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC3O15438 1527 aa16.67■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.67■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.65■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.65■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 MROH2AA6NES4 1674 aa16.65■□□□□ 0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.63■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 HFM1A2PYH4 1435 aa16.62■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.62■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 UNC13BO14795 1591 aa16.62■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.62■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.61■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 PZPP20742 1482 aa16.57■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP155O75694 1391 aa16.57■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 KANK1Q14678 1352 aa16.57■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.56■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 HSPA2P54652 639 aa16.56■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.55■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 NPATQ14207 1427 aa16.55■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.55■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.55■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM52Q96A61 297 aa16.53■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.53■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 ERVK-7P63135 1459 aa16.53■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.53■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.53■□□□□ 0.24
RPRD1B-202ENST00000449186 E9PCH4 1651 aa16.52■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TET3O43151 1660 aa16.52■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.52■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.51■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TNRQ92752 1358 aa16.51■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.5■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.5■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNMO15061 1565 aa16.48■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.48■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 FOXD1Q16676 465 aa16.47■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.46■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 NOS1P29475 1434 aa16.45■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 PKD2Q13563 968 aa16.44■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.42■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 IDI1Q13907 227 aa16.42■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3C2BO00750 1634 aa16.41■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.41■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 PLA2R1Q13018 1463 aa16.4■□□□□ 0.22
RPRD1B-202ENST00000449186 STRCQ7RTU9 1775 aa16.39■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP1Q9C000 1473 aa16.39■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.39■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.39■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.37■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.37■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPRTO14522 1441 aa16.36■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 CLTCL1P53675 1640 aa16.35■□□□□ 0.21
RPRD1B-202ENST00000449186 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.33■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.32■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRB3O60242 1522 aa16.32■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TRPM2O94759 1503 aa16.32■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.32■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 HRCP23327 699 aa16.31■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.31■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 LTKP29376 864 aa16.3■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.3■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.27■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.26■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 SLIT1O75093 1534 aa16.26■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.25■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.25■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.25■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF1BO60333 1816 aa16.24■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ZFYVE9O95405 1425 aa16.23■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.23■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
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