RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447577.5

CCDC18-AS1-216, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 431 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 JCADQ9P266 1359 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.33□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MAP3K1Q13233 1512 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SHPRHQ149N8 1683 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TNRQ92752 1358 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PREX2Q70Z35 1606 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRXQ9BXM0 1461 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 EP400Q96L91 3159 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ATP7AQ04656 1500 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.27□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PZPP20742 1482 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GGT6Q6P531 493 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TMEM94Q12767 1356 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 A2MP01023 1474 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TIAM1Q13009 1591 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AFF2P51816 1311 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NLRP1Q9C000 1473 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 YY1P25490 414 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DIP2AQ14689 1571 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.21□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FOXD1Q16676 465 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NWD1Q149M9 1564 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MIA2Q96PC5 1412 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLAIN2Q9P270 581 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NCOA2Q15596 1464 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LTKP29376 864 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLIT1O75093 1534 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MSH6P52701 1360 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CLIP1P30622 1438 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HRCP23327 699 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C8orf37Q96NL8 207 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ABCC3O15438 1527 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 20.1
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC125Q86Z20 511 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ERVK-7P63135 1459 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KCNA6P17658 529 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NGLY1Q96IV0 654 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TET3O43151 1660 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ATRNO75882 1429 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CEP350Q5VT06 3117 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PIK3C2BO00750 1634 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CEP152O94986 1710 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SETD5Q9C0A6 1442 aa11□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KIF3BO15066 747 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 UNC13BO14795 1591 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C1QTNF8P60827 252 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms