RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444220.2

AP000347.1-208, humanhuman

TSL 4

Gene AP000347.1, Length 618 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000347.1-208ENST00000444220 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.61■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.59■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 ABCC5O15440 1437 aa35.58■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 DAPK1P53355 1430 aa35.54■■■■□ 3.28
AP000347.1-208ENST00000444220 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.53■■■■□ 3.28
AP000347.1-208ENST00000444220 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.52■■■■□ 3.28
AP000347.1-208ENST00000444220 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
AP000347.1-208ENST00000444220 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.49■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 PZPP20742 1482 aa35.48■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 NCOA1Q15788 1441 aa35.48■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.46■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 CEP152O94986 1710 aa35.46■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 ABCC3O15438 1527 aa35.45■■■■□ 3.27
AP000347.1-208ENST00000444220 KIF15Q9NS87 1388 aa35.44■■■■□ 3.26
AP000347.1-208ENST00000444220 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
AP000347.1-208ENST00000444220 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.39■■■■□ 3.26
AP000347.1-208ENST00000444220 PTPRTO14522 1441 aa35.39■■■■□ 3.26
AP000347.1-208ENST00000444220 ERBINQ96RT1 1412 aa35.39■■■■□ 3.26
AP000347.1-208ENST00000444220 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.37■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.37■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 TNRQ92752 1358 aa35.37■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 DEPDC5O75140 1603 aa35.36■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 PLA2R1Q13018 1463 aa35.35■■■■□ 3.25
AP000347.1-208ENST00000444220 FBXO41Q8TF61 875 aa35.32■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.32■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 ADGRL2O95490 1459 aa35.31■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.3■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.3■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 CERKQ8TCT0 537 aa35.26■■■■□ 3.24
AP000347.1-208ENST00000444220 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.26■■■■□ 3.23
AP000347.1-208ENST00000444220 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
AP000347.1-208ENST00000444220 ERVK-7P63135 1459 aa35.24■■■■□ 3.23
AP000347.1-208ENST00000444220 NLRP1Q9C000 1473 aa35.23■■■■□ 3.23
AP000347.1-208ENST00000444220 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.21■■■■□ 3.23
AP000347.1-208ENST00000444220 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.19■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 PKD2Q13563 968 aa35.18■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.17■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.17■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.15■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
AP000347.1-208ENST00000444220 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.12■■■■□ 3.21
AP000347.1-208ENST00000444220 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.1■■■■□ 3.21
AP000347.1-208ENST00000444220 KANK1Q14678 1352 aa35.1■■■■□ 3.21
AP000347.1-208ENST00000444220 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
AP000347.1-208ENST00000444220 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.08■■■■□ 3.21
AP000347.1-208ENST00000444220 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
AP000347.1-208ENST00000444220 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.04■■■■□ 3.2
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
AP000347.1-208ENST00000444220 UNC13BO14795 1591 aa35■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 ROCK1Q13464 1354 aa35■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 PIK3C2BO00750 1634 aa34.99■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 SYNMO15061 1565 aa34.97■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 MED14O60244 1454 aa34.97■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 IQGAP1P46940 1657 aa34.96■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.96■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.96■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 TET3O43151 1660 aa34.95■■■■□ 3.19
AP000347.1-208ENST00000444220 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.93■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 ITGAEP38570 1179 aa34.91■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 NOS1P29475 1434 aa34.9■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 SLIT1O75093 1534 aa34.89■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.89■■■■□ 3.18
AP000347.1-208ENST00000444220 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
AP000347.1-208ENST00000444220 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.86■■■■□ 3.17
AP000347.1-208ENST00000444220 E9PCH4 1651 aa34.83■■■■□ 3.17
AP000347.1-208ENST00000444220 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
AP000347.1-208ENST00000444220 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.81■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 IDI1Q13907 227 aa34.8■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.8■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 ADGRB3O60242 1522 aa34.78■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 CPS1P31327 1500 aa34.78■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 LTKP29376 864 aa34.77■■■■□ 3.16
AP000347.1-208ENST00000444220 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.74■■■■□ 3.15
AP000347.1-208ENST00000444220 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.71■■■■□ 3.15
AP000347.1-208ENST00000444220 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.71■■■■□ 3.15
AP000347.1-208ENST00000444220 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.69■■■■□ 3.14
AP000347.1-208ENST00000444220 NUP155O75694 1391 aa34.69■■■■□ 3.14
AP000347.1-208ENST00000444220 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.66■■■■□ 3.14
AP000347.1-208ENST00000444220 EID1Q9Y6B2 187 aa34.65■■■■□ 3.14
AP000347.1-208ENST00000444220 NAIPQ13075 1403 aa34.64■■■■□ 3.14
AP000347.1-208ENST00000444220 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.6■■■■□ 3.13
AP000347.1-208ENST00000444220 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.59■■■■□ 3.13
AP000347.1-208ENST00000444220 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.58■■■■□ 3.13
AP000347.1-208ENST00000444220 ZFYVE9O95405 1425 aa34.56■■■■□ 3.12
AP000347.1-208ENST00000444220 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
AP000347.1-208ENST00000444220 ALKQ9UM73 1620 aa34.53■■■■□ 3.12
AP000347.1-208ENST00000444220 HFM1A2PYH4 1435 aa34.53■■■■□ 3.12
AP000347.1-208ENST00000444220 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.49■■■■□ 3.11
AP000347.1-208ENST00000444220 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms