RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGEF1-204ENST00000442563 ERBINQ96RT1 1412 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RABGEF1-204ENST00000442563 ROCK1Q13464 1354 aa25.7■■□□□ 1.71
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH2AA6NES4 1674 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGAEP38570 1179 aa25.65■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 C3P01024 1663 aa25.64■■□□□ 1.7
RABGEF1-204ENST00000442563 NPATQ14207 1427 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGEF1-204ENST00000442563 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.681e-6■■■■□ 20.8
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC3O15438 1527 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 KANK1Q14678 1352 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 PZPP20742 1482 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 DEPDC5O75140 1603 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPA2P54652 639 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 TNRQ92752 1358 aa25.45■■□□□ 1.67
RABGEF1-204ENST00000442563 NAIPQ13075 1403 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1-204ENST00000442563 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP152O94986 1710 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1-204ENST00000442563 HFM1A2PYH4 1435 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVK-7P63135 1459 aa25.39■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC13BO14795 1591 aa25.39■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.39■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP155O75694 1391 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP1Q9C000 1473 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 NOS1P29475 1434 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 TET3O43151 1660 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2R1Q13018 1463 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1-204ENST00000442563 PKD2Q13563 968 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 IDI1Q13907 227 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM52Q96A61 297 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 STRCQ7RTU9 1775 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRTO14522 1441 aa25.2■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.2■■□□□ 1.63
RABGEF1-204ENST00000442563 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNMO15061 1565 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 E9PCH4 1651 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1-204ENST00000442563 HRCP23327 699 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 PIK3C2BO00750 1634 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 SLIT1O75093 1534 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 EID1Q9Y6B2 187 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 MED14O60244 1454 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRB3O60242 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 LTKP29376 864 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPM2O94759 1503 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXD1Q16676 465 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFYVE9O95405 1425 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGEF1-204ENST00000442563 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CERKQ8TCT0 537 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1-204ENST00000442563 IQGAP1P46940 1657 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 425.5 ms