RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440445.5

AFF3-211, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-211ENST00000440445 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.81■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.8■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 FBXO41Q8TF61 875 aa41.77■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 NCOA1Q15788 1441 aa41.77■■■■■ 4.28
AFF3-211ENST00000440445 ABCC5O15440 1437 aa41.75■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 PTPRTO14522 1441 aa41.74■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 PZPP20742 1482 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 DAPK1P53355 1430 aa41.69■■■■■ 4.27
AFF3-211ENST00000440445 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
AFF3-211ENST00000440445 PLA2R1Q13018 1463 aa41.65■■■■■ 4.26
AFF3-211ENST00000440445 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.64■■■■■ 4.26
AFF3-211ENST00000440445 KIF15Q9NS87 1388 aa41.63■■■■■ 4.26
AFF3-211ENST00000440445 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.63■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 ABCC3O15438 1527 aa41.63■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 TNRQ92752 1358 aa41.62■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 CERKQ8TCT0 537 aa41.6■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 ERBINQ96RT1 1412 aa41.6■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
AFF3-211ENST00000440445 PKD2Q13563 968 aa41.52■■■■■ 4.24
AFF3-211ENST00000440445 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.52■■■■■ 4.24
AFF3-211ENST00000440445 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
AFF3-211ENST00000440445 CEP152O94986 1710 aa41.5■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.5■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 NLRP1Q9C000 1473 aa41.49■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 DEPDC5O75140 1603 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-211ENST00000440445 ADGRL2O95490 1459 aa41.44■■■■■ 4.22
AFF3-211ENST00000440445 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-211ENST00000440445 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-211ENST00000440445 ERVK-7P63135 1459 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-211ENST00000440445 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
AFF3-211ENST00000440445 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
AFF3-211ENST00000440445 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.36■■■■■ 4.21
AFF3-211ENST00000440445 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.36■■■■■ 4.21
AFF3-211ENST00000440445 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
AFF3-211ENST00000440445 KANK1Q14678 1352 aa41.32■■■■■ 4.21
AFF3-211ENST00000440445 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.28■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.28■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.2
AFF3-211ENST00000440445 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
AFF3-211ENST00000440445 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.22■■■■■ 4.19
AFF3-211ENST00000440445 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
AFF3-211ENST00000440445 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.2■■■■■ 4.19
AFF3-211ENST00000440445 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.18■■■■■ 4.18
AFF3-211ENST00000440445 MED14O60244 1454 aa41.17■■■■■ 4.18
AFF3-211ENST00000440445 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.13■■■■■ 4.17
AFF3-211ENST00000440445 ROCK1Q13464 1354 aa41.12■■■■■ 4.17
AFF3-211ENST00000440445 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
AFF3-211ENST00000440445 IQGAP1P46940 1657 aa41.07■■■■■ 4.16
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AFF3-211ENST00000440445 PIK3C2BO00750 1634 aa41.04■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 UNC13BO14795 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 SLIT1O75093 1534 aa41.03■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.02■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 NOS1P29475 1434 aa41.01■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
AFF3-211ENST00000440445 SYNMO15061 1565 aa41■■■■■ 4.15
AFF3-211ENST00000440445 CPS1P31327 1500 aa41■■■■■ 4.15
AFF3-211ENST00000440445 TET3O43151 1660 aa41■■■■■ 4.15
AFF3-211ENST00000440445 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
AFF3-211ENST00000440445 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.94■■■■■ 4.15
AFF3-211ENST00000440445 IDI1Q13907 227 aa40.91■■■■■ 4.14
AFF3-211ENST00000440445 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
AFF3-211ENST00000440445 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.88■■■■■ 4.14
AFF3-211ENST00000440445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 LTKP29376 864 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 ITGAEP38570 1179 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.86■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.86■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 ADGRB3O60242 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 EID1Q9Y6B2 187 aa40.85■■■■■ 4.13
AFF3-211ENST00000440445 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.81■■■■■ 4.12
AFF3-211ENST00000440445 E9PCH4 1651 aa40.8■■■■■ 4.12
AFF3-211ENST00000440445 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.79■■■■■ 4.12
AFF3-211ENST00000440445 NUP155O75694 1391 aa40.74■■■■■ 4.11
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AFF3-211ENST00000440445 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.67■■■■■ 4.1
AFF3-211ENST00000440445 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.67■■■■■ 4.1
AFF3-211ENST00000440445 TOM1O60784 492 aa40.63■■■■■ 4.09
AFF3-211ENST00000440445 ZFYVE9O95405 1425 aa40.61■■■■■ 4.09
AFF3-211ENST00000440445 NAIPQ13075 1403 aa40.59■■■■■ 4.09
AFF3-211ENST00000440445 ALKQ9UM73 1620 aa40.54■■■■■ 4.08
AFF3-211ENST00000440445 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.54■■■■■ 4.08
AFF3-211ENST00000440445 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
AFF3-211ENST00000440445 HFM1A2PYH4 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.5■■■■■ 4.07
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