RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 COG6Q9Y2V7 657 aa7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4CQ08493 712 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF12Q96QT6 1004 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR7Q9Y216 660 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 IRF5Q13568 498 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 BANK1Q8NDB2 785 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPC6Q9Y210 931 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf72A6NCS6 295 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF3CO14782 793 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D12O60347 775 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TIE1P35590 1138 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 WWC1Q8IX03 1113 aa7.72□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.72□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXW7Q969H0 707 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 OTUD5Q96G74 571 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRKQ9NRH2 765 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.7□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEB2H3BUK9 544 aa7.7□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.7□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 EVI5O60447 810 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC5P40937 340 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PHOX2BQ99453 314 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.67□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 G3V3G9 751 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNA1Q09470 495 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 E9PSI1 815 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 BRD1O95696 1058 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF428Q96B54 188 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 EPAS1Q99814 870 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 OATP04181 439 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 GLMNQ92990 594 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 SOCS7O14512 581 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K7O43318 606 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF3O75054 1194 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF14O94880 888 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ABL2P42684 1182 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 USTQ9Y2C2 406 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 C7P10643 843 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A7Q92504 469 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 METRNQ9UJH8 293 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 POM121CA8CG34 1229 aa7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 OCEL1Q9H607 264 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEJP0CG39 1038 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM161AQ3B820 660 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP7Q8WX94 980 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEMA6NI47 508 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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