RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.46■■□□□ 1.51
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NELFE-204ENST00000436289 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-204ENST00000436289 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-204ENST00000436289 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-204ENST00000436289 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-204ENST00000436289 MED14O60244 1454 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-204ENST00000436289 PZPP20742 1482 aa24.39■■□□□ 1.5
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NELFE-204ENST00000436289 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.39■■□□□ 1.49
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NELFE-204ENST00000436289 MIA2Q96PC5 1412 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-204ENST00000436289 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-204ENST00000436289 MBD5Q9P267 1494 aa24.36■■□□□ 1.49
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NELFE-204ENST00000436289 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-204ENST00000436289 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
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NELFE-204ENST00000436289 ALKQ9UM73 1620 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-204ENST00000436289 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-204ENST00000436289 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-204ENST00000436289 IQGAP1P46940 1657 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-204ENST00000436289 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-204ENST00000436289 TSPY4P0CV99 314 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-204ENST00000436289 TSPY10P0CW01 314 aa24.22■■□□□ 1.47
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NELFE-204ENST00000436289 TIAM1Q13009 1591 aa24.2■■□□□ 1.47
NELFE-204ENST00000436289 CEP162Q5TB80 1403 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-204ENST00000436289 SYNMO15061 1565 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-204ENST00000436289 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NELFE-204ENST00000436289 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-204ENST00000436289 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 EID1Q9Y6B2 187 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-204ENST00000436289 ERVK-7P63135 1459 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 ABCC3O15438 1527 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 LTKP29376 864 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 POTEAQ6S8J7 498 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 NCOA2Q15596 1464 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-204ENST00000436289 SLIT1O75093 1534 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-204ENST00000436289 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.98■■□□□ 1.43
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NELFE-204ENST00000436289 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NELFE-204ENST00000436289 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.96■■□□□ 1.43
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NELFE-204ENST00000436289 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.93■■□□□ 1.42
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NELFE-204ENST00000436289 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.87■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.87■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 JCADQ9P266 1359 aa23.87■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 SLAIN2Q9P270 581 aa23.86■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.84■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 MSH6P52701 1360 aa23.84■■□□□ 1.41
NELFE-204ENST00000436289 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.83■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 CEP152O94986 1710 aa23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 KANK1Q14678 1352 aa23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 IDI1Q13907 227 aa23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.79■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 ERBINQ96RT1 1412 aa23.79■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.79■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 MAP3K1Q13233 1512 aa23.79■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 TET3O43151 1660 aa23.78■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 PIK3C2BO00750 1634 aa23.77■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 KIF15Q9NS87 1388 aa23.77■■□□□ 1.4
NELFE-204ENST00000436289 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
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NELFE-204ENST00000436289 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.76■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 BCANQ96GW7 911 aa23.75■■□□□ 1.39
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NELFE-204ENST00000436289 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.73■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.73■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 PHLPP1O60346 1717 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-204ENST00000436289 NWD1Q149M9 1564 aa23.7■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.69■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 RXRBP28702 533 aa23.68■■□□□ 1.38
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