RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTBP11-201ENST00000436287 TNRQ92752 1358 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTBP11-201ENST00000436287 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 PZPP20742 1482 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 NCOA2Q15596 1464 aa23.89■■□□□ 1.42
ACTBP11-201ENST00000436287 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MIA2Q96PC5 1412 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TSPY4P0CV99 314 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TSPY10P0CW01 314 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TOM1O60784 492 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CPS1P31327 1500 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPA1LP34931 641 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PIP4K2BP78356 416 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTBP11-201ENST00000436287 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 NLRP1Q9C000 1473 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 MED14O60244 1454 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ACTBP11-201ENST00000436287 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTBP11-201ENST00000436287 DEPDC5O75140 1603 aa23.7■■□□□ 1.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCC3O15438 1527 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ERVK-7P63135 1459 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ALKQ9UM73 1620 aa23.64■■□□□ 1.38
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 IQGAP1P46940 1657 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 MAP3K1Q13233 1512 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 LTKP29376 864 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTBP11-201ENST00000436287 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF15Q9NS87 1388 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 EID1Q9Y6B2 187 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 SLIT1O75093 1534 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCC5O15440 1437 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 ERBINQ96RT1 1412 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 SYNMO15061 1565 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP152O94986 1710 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTBP11-201ENST00000436287 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 KANK1Q14678 1352 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 IDI1Q13907 227 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 DAPK1P53355 1430 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 APLP2Q06481 763 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNA6P17658 529 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM94Q12767 1356 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PIK3C2BO00750 1634 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 NOS1P29475 1434 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TET3O43151 1660 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTBP11-201ENST00000436287 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTBP11-201ENST00000436287 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTBP11-201ENST00000436287 BCANQ96GW7 911 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTBP11-201ENST00000436287 POTEAQ6S8J7 498 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRL2O95490 1459 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTBP11-201ENST00000436287 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRB3O60242 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
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