RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431155.1

GRAMD4-204, Transcript of GRAM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene GRAMD4, Length 311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF15Q9NS87 1388 aa47.02■■■■■ 5.12
GRAMD4-204ENST00000431155 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.02■■■■■ 5.12
GRAMD4-204ENST00000431155 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.02■■■■■ 5.12
GRAMD4-204ENST00000431155 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.01■■■■■ 5.12
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM5DQ9BY66 1539 aa47■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa46.98■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPRKQ15262 1439 aa46.97■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 FAM135AQ9P2D6 1515 aa46.95■■■■■ 5.11
GRAMD4-204ENST00000431155 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa46.9■■■■■ 5.1
GRAMD4-204ENST00000431155 ERBINQ96RT1 1412 aa46.87■■■■■ 5.09
GRAMD4-204ENST00000431155 MROH1Q8NDA8 1641 aa46.84■■■■■ 5.09
GRAMD4-204ENST00000431155 NCOA1Q15788 1441 aa46.84■■■■■ 5.09
GRAMD4-204ENST00000431155 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 PZPP20742 1482 aa46.81■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC3O15438 1527 aa46.8■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 MYO3AQ8NEV4 1616 aa46.79■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRL2O95490 1459 aa46.79■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
GRAMD4-204ENST00000431155 STRCQ7RTU9 1775 aa46.73■■■■■ 5.07
GRAMD4-204ENST00000431155 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
GRAMD4-204ENST00000431155 TNRQ92752 1358 aa46.7■■■■■ 5.07
GRAMD4-204ENST00000431155 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.07
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.07
GRAMD4-204ENST00000431155 CEP152O94986 1710 aa46.69■■■■■ 5.06
GRAMD4-204ENST00000431155 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP46.69■■■■■ 5.06
GRAMD4-204ENST00000431155 DEPDC5O75140 1603 aa46.65■■■■■ 5.06
GRAMD4-204ENST00000431155 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa46.65■■■■■ 5.06
GRAMD4-204ENST00000431155 ITGAEP38570 1179 aa46.62■■■■■ 5.05
GRAMD4-204ENST00000431155 A2ML1A8K2U0 1454 aa46.6■■■■■ 5.05
GRAMD4-204ENST00000431155 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP46.6■■■■■ 5.053e-7■■■■■ 153.6
GRAMD4-204ENST00000431155 DMRT2Q9Y5R5 561 aa46.59■■■■■ 5.05
GRAMD4-204ENST00000431155 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa46.58■■■■■ 5.05
GRAMD4-204ENST00000431155 KANK1Q14678 1352 aa46.57■■■■■ 5.05
GRAMD4-204ENST00000431155 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa46.52■■■■■ 5.04
GRAMD4-204ENST00000431155 ERVK-7P63135 1459 aa46.51■■■■■ 5.04
GRAMD4-204ENST00000431155 ROCK1Q13464 1354 aa46.51■■■■■ 5.04
GRAMD4-204ENST00000431155 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa46.49■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 VWDEQ8N2E2 1590 aa46.47■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 PLA2R1Q13018 1463 aa46.47■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 NLRP1Q9C000 1473 aa46.47■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPRTO14522 1441 aa46.46■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.46■■■■■ 5.03
GRAMD4-204ENST00000431155 LMTK2Q8IWU2 1503 aa46.43■■■■■ 5.02
GRAMD4-204ENST00000431155 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
GRAMD4-204ENST00000431155 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
GRAMD4-204ENST00000431155 PKD2Q13563 968 aa46.37■■■■■ 5.01
GRAMD4-204ENST00000431155 UGGT1Q9NYU2 1555 aa46.37■■■■■ 5.01
GRAMD4-204ENST00000431155 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
GRAMD4-204ENST00000431155 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.3■■■■■ 5
GRAMD4-204ENST00000431155 UNC13BO14795 1591 aa46.29■■■■■ 5
GRAMD4-204ENST00000431155 CERKQ8TCT0 537 aa46.24■■■■■ 4.99
GRAMD4-204ENST00000431155 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
GRAMD4-204ENST00000431155 ANKLE2Q86XL3 938 aa46.19■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 TET3O43151 1660 aa46.17■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 FBXO41Q8TF61 875 aa46.17■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 NEURL4Q96JN8 1562 aa46.17■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 UBR1Q8IWV7 1749 aa46.17■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 SYNMO15061 1565 aa46.14■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 NOS1P29475 1434 aa46.14■■■■■ 4.98
GRAMD4-204ENST00000431155 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 NUP155O75694 1391 aa46.11■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 PIK3C2BO00750 1634 aa46.11■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 IQGAP3Q86VI3 1631 aa46.1■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.1■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.1■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 IDI1Q13907 227 aa46.08■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 NAIPQ13075 1403 aa46.07■■■■■ 4.97
GRAMD4-204ENST00000431155 STAG3Q9UJ98 1225 aa46.04■■■■■ 4.96
GRAMD4-204ENST00000431155 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
GRAMD4-204ENST00000431155 MED14O60244 1454 aa46.01■■■■■ 4.96
GRAMD4-204ENST00000431155 E9PCH4 1651 aa46.01■■■■■ 4.96
GRAMD4-204ENST00000431155 SLC52A1Q9NWF4 448 aa45.98■■■■■ 4.95
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGAP23Q9P227 1491 aa45.97■■■■■ 4.95
GRAMD4-204ENST00000431155 SLIT1O75093 1534 aa45.97■■■■■ 4.95
GRAMD4-204ENST00000431155 HFM1A2PYH4 1435 aa45.95■■■■■ 4.95
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
GRAMD4-204ENST00000431155 IQGAP1P46940 1657 aa45.93■■■■■ 4.94
GRAMD4-204ENST00000431155 LTKP29376 864 aa45.93■■■■■ 4.94
GRAMD4-204ENST00000431155 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
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GRAMD4-204ENST00000431155 TMEM2Q9UHN6 1383 aa45.92■■■■■ 4.94
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRB3O60242 1522 aa45.91■■■■■ 4.94
GRAMD4-204ENST00000431155 EID1Q9Y6B2 187 aa45.87■■■■■ 4.93
GRAMD4-204ENST00000431155 IQSEC2Q5JU85 1478 aa45.77■■■■■ 4.92
GRAMD4-204ENST00000431155 TRIM52Q96A61 297 aa45.77■■■■■ 4.92
GRAMD4-204ENST00000431155 CHGAP10645 457 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
GRAMD4-204ENST00000431155 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa45.74■■■■■ 4.91
GRAMD4-204ENST00000431155 MYO5BQ9ULV0 1848 aa45.72■■■■■ 4.91
GRAMD4-204ENST00000431155 CPS1P31327 1500 aa45.7■■■■■ 4.91
GRAMD4-204ENST00000431155 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa45.67■■■■■ 4.9
GRAMD4-204ENST00000431155 ZFYVE9O95405 1425 aa45.63■■■■■ 4.9
GRAMD4-204ENST00000431155 RIMS2Q9UQ26 1411 aa45.63■■■■■ 4.9
GRAMD4-204ENST00000431155 STRCP1A6NGW2 1772 aa45.6■■■■■ 4.89
GRAMD4-204ENST00000431155 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
GRAMD4-204ENST00000431155 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
GRAMD4-204ENST00000431155 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
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