RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429254.1

LNCPRESS1-201, Transcript of lncRNA p53 regulated and ESC associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNCPRESS1, Length 756 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.84■■□□□ 1.41
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LNCPRESS1-201ENST00000429254 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.82■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.81■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KIF15Q9NS87 1388 aa23.81■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.79■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.77■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZMYM3Q14202 1370 aa23.77■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.77■■□□□ 1.4
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ADGRL2O95490 1459 aa23.76■■□□□ 1.39
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LNCPRESS1-201ENST00000429254 ERBINQ96RT1 1412 aa23.75■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.74■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NCOA1Q15788 1441 aa23.74■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CEP152O94986 1710 aa23.73■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PTPRKQ15262 1439 aa23.73■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DEPDC5O75140 1603 aa23.7■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.69■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.69■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ABCC3O15438 1527 aa23.69■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NPATQ14207 1427 aa23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ITGAEP38570 1179 aa23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HSPA2P54652 639 aa23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.66■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.66■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PZPP20742 1482 aa23.64■■□□□ 1.38
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.61■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ROCK1Q13464 1354 aa23.61■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 STRCQ7RTU9 1775 aa23.56■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KANK1Q14678 1352 aa23.55■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TNRQ92752 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UNC13BO14795 1591 aa23.53■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.52■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.52■■□□□ 1.36
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ERVK-7P63135 1459 aa23.51■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.5■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.49■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.49■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.49■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TET3O43151 1660 aa23.46■■□□□ 1.35
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.44■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NLRP1Q9C000 1473 aa23.44■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NAIPQ13075 1403 aa23.42■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.41■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PLA2R1Q13018 1463 aa23.4■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 E9PCH4 1651 aa23.39■■□□□ 1.34
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.39■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SYNMO15061 1565 aa23.38■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HFM1A2PYH4 1435 aa23.37■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUP155O75694 1391 aa23.37■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PIK3C2BO00750 1634 aa23.37■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.35■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.34■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NOS1P29475 1434 aa23.33■■□□□ 1.33
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PTPRTO14522 1441 aa23.33■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.31■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PKD2Q13563 968 aa23.29■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.28■■□□□ 1.32
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.25■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IDI1Q13907 227 aa23.25■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ADGRB3O60242 1522 aa23.24■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.23■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IQGAP1P46940 1657 aa23.22■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRIM52Q96A61 297 aa23.22■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.22■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLIT1O75093 1534 aa23.22■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.21■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.21■■□□□ 1.31
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.19■■□□□ 1.3
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MED14O60244 1454 aa23.18■■□□□ 1.3
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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LNCPRESS1-201ENST00000429254 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.15■■□□□ 1.3
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.14■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LTKP29376 864 aa23.13■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.12■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CERKQ8TCT0 537 aa23.12■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRPM2O94759 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CLTCL1P53675 1640 aa23.11■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EID1Q9Y6B2 187 aa23.11■■□□□ 1.29
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