RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 HSPA2P54652 639 aa16.05■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 APLP2Q06481 763 aa16.04■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.03■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 PTPRKQ15262 1439 aa16.02■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 KIF15Q9NS87 1388 aa16.02■□□□□ 0.16
HDLBP-216ENST00000428482 ADGRL2O95490 1459 aa16.02■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.02■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 PZPP20742 1482 aa15.99■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 GGT6Q6P531 493 aa15.99■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 ERBINQ96RT1 1412 aa15.99■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 NPATQ14207 1427 aa15.97■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 ZMYM3Q14202 1370 aa15.97■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 UNC13BO14795 1591 aa15.96■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.96■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 KIF3BO15066 747 aa15.96■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HDLBP-216ENST00000428482 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.96■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.94■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.93■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 ERVK-7P63135 1459 aa15.93■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.93■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.92■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 TSPY4P0CV99 314 aa15.92■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 TSPY10P0CW01 314 aa15.92■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 NCOA1Q15788 1441 aa15.92■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.91■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 SYNMO15061 1565 aa15.91■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.9■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.9■□□□□ 0.14
HDLBP-216ENST00000428482 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.89■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.88■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 PIK3C2BO00750 1634 aa15.88■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 TET3O43151 1660 aa15.88■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.88■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 TNRQ92752 1358 aa15.87■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.86■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 E9PCH4 1651 aa15.86■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.86■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.85■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 PLA2R1Q13018 1463 aa15.84■□□□□ 0.13
HDLBP-216ENST00000428482 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.83■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.83■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 ITGAEP38570 1179 aa15.81■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 NLRP1Q9C000 1473 aa15.8■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 IQGAP1P46940 1657 aa15.79■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.79■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 ADGRB3O60242 1522 aa15.79■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 ROCK1Q13464 1354 aa15.79■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.122e-10■■■□□ 16.7
HDLBP-216ENST00000428482 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.78■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.77■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.77■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.122e-7■□□□□ 8.8
HDLBP-216ENST00000428482 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.77■□□□□ 0.12
HDLBP-216ENST00000428482 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.75■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 PTPRTO14522 1441 aa15.75■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 NOS1P29475 1434 aa15.74■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 NAIPQ13075 1403 aa15.73■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 KANK1Q14678 1352 aa15.72■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 SLIT1O75093 1534 aa15.71■□□□□ 0.11
HDLBP-216ENST00000428482 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.71■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.7■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 CLTCL1P53675 1640 aa15.7■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 HFM1A2PYH4 1435 aa15.68■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 MED14O60244 1454 aa15.66■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HDLBP-216ENST00000428482 TRPM2O94759 1503 aa15.63■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 NUP155O75694 1391 aa15.62■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 ALKQ9UM73 1620 aa15.61■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.61■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 ZFYVE9O95405 1425 aa15.6■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 NWD1Q149M9 1564 aa15.59■□□□□ 0.09
HDLBP-216ENST00000428482 PKD2Q13563 968 aa15.58■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 CERKQ8TCT0 537 aa15.58■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.58■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 KIF1BO60333 1816 aa15.57■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 LTKP29376 864 aa15.56■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 IDI1Q13907 227 aa15.56■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 CPS1P31327 1500 aa15.56■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.55■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.55■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 FBXO41Q8TF61 875 aa15.54■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.54■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.53■□□□□ 0.08
HDLBP-216ENST00000428482 IFT172Q9UG01 1749 aa15.53■□□□□ 0.08
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