RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HRCP23327 699 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UNC13BO14795 1591 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.01■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KDM5DQ9BY66 1539 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GGT6Q6P531 493 aa19.99■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.99■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KANK1Q14678 1352 aa19.98■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUP155O75694 1391 aa19.96■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.96■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MLECQ14165 292 aa19.95■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRIM52Q96A61 297 aa19.95■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.94■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCC3O15438 1527 aa19.93■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.92■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PZPP20742 1482 aa19.92■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.91■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.91■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEP152O94986 1710 aa19.9■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.9■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TET3O43151 1660 aa19.89■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MROH2AA6NES4 1674 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MADDQ8WXG6 1647 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa19.85■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.85■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZMYM3Q14202 1370 aa19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 E9PCH4 1651 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PKD2Q13563 968 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPATQ14207 1427 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C3P01024 1663 aa19.77■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.75■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTPRMP28827 1452 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ERVK-7P63135 1459 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTPRTO14522 1441 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NOS1P29475 1434 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FOXD1Q16676 465 aa19.71■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRPM2O94759 1503 aa19.71■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLA2R1Q13018 1463 aa19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SYNMO15061 1565 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNRQ92752 1358 aa19.67■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIK3C2BO00750 1634 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NLRP1Q9C000 1473 aa19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CLTCL1P53675 1640 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IDI1Q13907 227 aa19.58■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.56■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF1BO60333 1816 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADGRB3O60242 1522 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NEUROD1Q13562 356 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLIT1O75093 1534 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TONSLQ96HA7 1378 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RGL3Q3MIN7 710 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZFYVE9O95405 1425 aa19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms