RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-204ENST00000422770 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-204ENST00000422770 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.77□□□□□ -0.04
HERC3-204ENST00000422770 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 ERBINQ96RT1 1412 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 ZMYM3Q14202 1370 aa14.73□□□□□ -0.05
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HERC3-204ENST00000422770 ADGRL2O95490 1459 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 NCOA1Q15788 1441 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 HSPA2P54652 639 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-204ENST00000422770 DEPDC5O75140 1603 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 PTPRKQ15262 1439 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 ABCC3O15438 1527 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 KANK1Q14678 1352 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 NPATQ14207 1427 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
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HERC3-204ENST00000422770 PZPP20742 1482 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-204ENST00000422770 ROCK1Q13464 1354 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 TNRQ92752 1358 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 UNC13BO14795 1591 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 STRCQ7RTU9 1775 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 TET3O43151 1660 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 ERVK-7P63135 1459 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-204ENST00000422770 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 FBXO41Q8TF61 875 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 NLRP1Q9C000 1473 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 E9PCH4 1651 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 NUP155O75694 1391 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 PIK3C2BO00750 1634 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 NAIPQ13075 1403 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-204ENST00000422770 TRIM52Q96A61 297 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 HFM1A2PYH4 1435 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 SYNMO15061 1565 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 PLA2R1Q13018 1463 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HERC3-204ENST00000422770 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.49□□□□□ -0.09
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HERC3-204ENST00000422770 NOS1P29475 1434 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 PKD2Q13563 968 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 ADGRB3O60242 1522 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 IQGAP1P46940 1657 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.43□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 PTPRTO14522 1441 aa14.43□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.43□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 IDI1Q13907 227 aa14.42□□□□□ -0.1
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HERC3-204ENST00000422770 KIF1BO60333 1816 aa14.41□□□□□ -0.1
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HERC3-204ENST00000422770 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.4□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
HERC3-204ENST00000422770 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 EID1Q9Y6B2 187 aa14.39□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.39□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 CLTCL1P53675 1640 aa14.38□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 SLIT1O75093 1534 aa14.38□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.38□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 CERKQ8TCT0 537 aa14.38□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 BCANQ96GW7 911 aa14.37□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 TRPM2O94759 1503 aa14.36□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
HERC3-204ENST00000422770 MED14O60244 1454 aa14.34□□□□□ -0.11
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