RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.97■■□□□ 1.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC13BO14795 1591 aa24.97■■□□□ 1.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGLP35573 1532 aa24.96■■□□□ 1.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 KANK1Q14678 1352 aa24.94■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.94■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.94■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PZPP20742 1482 aa24.92■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEPDC5O75140 1603 aa24.92■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.91■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGT6Q6P531 493 aa24.89■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.89■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKD2Q13563 968 aa24.83■■□□□ 1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.82■■□□□ 1.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.77■■□□□ 1.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC3O15438 1527 aa24.76■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MLECQ14165 292 aa24.74■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXD1Q16676 465 aa24.74■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TET3O43151 1660 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.72■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.7■■□□□ 1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.67■■□□□ 1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPATQ14207 1427 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRTO14522 1441 aa24.64■■□□□ 1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP152O94986 1710 aa24.64■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.63■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 E9PCH4 1651 aa24.63■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA2R1Q13018 1463 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.59■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEUROD1Q13562 356 aa24.59■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYM3Q14202 1370 aa24.59■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.59■■□□□ 1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPM2O94759 1503 aa24.58■■□□□ 1.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOS1P29475 1434 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH2AA6NES4 1674 aa24.52■■□□□ 1.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVK-7P63135 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 TONSLQ96HA7 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.5■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.49■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.49■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.46■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 MADDQ8WXG6 1647 aa24.45■■□□□ 1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNMO15061 1565 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLTCL1P53675 1640 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNRQ92752 1358 aa24.41■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 IDI1Q13907 227 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3C2BO00750 1634 aa24.39■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3P01024 1663 aa24.36■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGL3Q3MIN7 710 aa24.35■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAC3Q96MF2 364 aa24.34■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRMP28827 1452 aa24.33■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP1Q9C000 1473 aa24.33■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRB3O60242 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.31■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.3■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF1BO60333 1816 aa24.25■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.24■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.23■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.23■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOM2P54296 1465 aa24.2■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.18■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.17■■□□□ 1.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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