RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.97■■□□□ 1.27
NFE4-201ENST00000420058 TNRQ92752 1358 aa22.95■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.92■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 PZPP20742 1482 aa22.92■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.91■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.91■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 NCOA2Q15596 1464 aa22.91■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.91■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 MIA2Q96PC5 1412 aa22.9■■□□□ 1.26
NFE4-201ENST00000420058 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.89■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 HSPA1LP34931 641 aa22.88■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.87■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.87■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.87■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.85■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 PIP4K2BP78356 416 aa22.84■■□□□ 1.25
NFE4-201ENST00000420058 CPS1P31327 1500 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 TOM1O60784 492 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 TSPY4P0CV99 314 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 TSPY10P0CW01 314 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 MED14O60244 1454 aa22.81■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.8■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 NLRP1Q9C000 1473 aa22.8■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 ALKQ9UM73 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.78■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NFE4-201ENST00000420058 DEPDC5O75140 1603 aa22.75■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 ABCC3O15438 1527 aa22.73■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.73■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NFE4-201ENST00000420058 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.7■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 ERVK-7P63135 1459 aa22.69■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.68■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.68■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.68■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.68■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.66■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 LTKP29376 864 aa22.66■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 IQGAP1P46940 1657 aa22.65■■□□□ 1.22
NFE4-201ENST00000420058 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.61■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 MAP3K1Q13233 1512 aa22.59■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.59■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.59■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.58■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.58■■□□□ 1.21
NFE4-201ENST00000420058 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.57■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 CEP152O94986 1710 aa22.57■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 ABCC5O15440 1437 aa22.57■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 SLIT1O75093 1534 aa22.56■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.55■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 KIF15Q9NS87 1388 aa22.54■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NFE4-201ENST00000420058 SYNMO15061 1565 aa22.51■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.5■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 ERBINQ96RT1 1412 aa22.49■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 IDI1Q13907 227 aa22.49■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 EID1Q9Y6B2 187 aa22.48■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NFE4-201ENST00000420058 PIK3C2BO00750 1634 aa22.44■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 DAPK1P53355 1430 aa22.44■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.43■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 KCNA6P17658 529 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 TMEM94Q12767 1356 aa22.41■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 TET3O43151 1660 aa22.41■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.41■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.4■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.4■■□□□ 1.18
NFE4-201ENST00000420058 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.39■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 NOS1P29475 1434 aa22.39■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.39■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 KANK1Q14678 1352 aa22.38■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.37■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.36■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 POTEAQ6S8J7 498 aa22.34■■□□□ 1.17
NFE4-201ENST00000420058 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.32■■□□□ 1.16
NFE4-201ENST00000420058 APLP2Q06481 763 aa22.3■■□□□ 1.16
NFE4-201ENST00000420058 ADGRL2O95490 1459 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE4-201ENST00000420058 ADGRB3O60242 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE4-201ENST00000420058 ZFYVE9O95405 1425 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE4-201ENST00000420058 SLAIN2Q9P270 581 aa22.26■■□□□ 1.15
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