RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRL2O95490 1459 aa26.54■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA1Q15788 1441 aa26.52■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERBINQ96RT1 1412 aa26.52■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.48■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.48■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRKQ15262 1439 aa26.48■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGAEP38570 1179 aa26.47■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZMYM3Q14202 1370 aa26.46■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.45■■□□□ 1.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MROH2AA6NES4 1674 aa26.45■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ROCK1Q13464 1354 aa26.45■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.43■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3P01024 1663 aa26.42■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.39■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STRCQ7RTU9 1775 aa26.38■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.37■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CERKQ8TCT0 537 aa26.37■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPATQ14207 1427 aa26.37■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC3O15438 1527 aa26.35■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KANK1Q14678 1352 aa26.33■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.33■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEPDC5O75140 1603 aa26.32■■□□□ 1.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PZPP20742 1482 aa26.31■■□□□ 1.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.25■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP152O94986 1710 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNRQ92752 1358 aa26.21■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.21■■□□□ 1.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRTO14522 1441 aa26.2■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UNC13BO14795 1591 aa26.2■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HFM1A2PYH4 1435 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAIPQ13075 1403 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-7P63135 1459 aa26.17■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.16■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.14■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRP1Q9C000 1473 aa26.12■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP155O75694 1391 aa26.12■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.11■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.1■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.08■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TET3O43151 1660 aa26.08■■□□□ 1.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOS1P29475 1434 aa26.02■■□□□ 1.76
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLA2R1Q13018 1463 aa26.02■■□□□ 1.76
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.01■■□□□ 1.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.01■■□□□ 1.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM52Q96A61 297 aa25.99■■□□□ 1.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNMO15061 1565 aa25.96■■□□□ 1.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E9PCH4 1651 aa25.95■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.95■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKD2Q13563 968 aa25.94■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.94■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IDI1Q13907 227 aa25.92■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.92■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.91■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3C2BO00750 1634 aa25.89■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.88■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.88■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.86■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRB3O60242 1522 aa25.85■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.83■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ILDR2Q71H61 639 aa25.83■■□□□ 1.73
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLIT1O75093 1534 aa25.82■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.82■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.81■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.8■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EID1Q9Y6B2 187 aa25.79■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.79■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.78■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPM2O94759 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.77■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED14O60244 1454 aa25.77■■□□□ 1.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.74■■□□□ 1.71
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HRCP23327 699 aa25.73■■□□□ 1.71
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LTKP29376 864 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.1 ms