RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414380.1

SH2D3C-204, Transcript of SH2 domain containing 3C, humanhuman

TSL 3

Gene SH2D3C, Length 778 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3C-204ENST00000414380 KDM5DQ9BY66 1539 aa42■■■■■ 4.31
SH2D3C-204ENST00000414380 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42■■■■■ 4.31
SH2D3C-204ENST00000414380 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SH2D3C-204ENST00000414380 KIF15Q9NS87 1388 aa41.97■■■■■ 4.31
SH2D3C-204ENST00000414380 NPATQ14207 1427 aa41.96■■■■■ 4.31
SH2D3C-204ENST00000414380 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SH2D3C-204ENST00000414380 PTPRKQ15262 1439 aa41.89■■■■■ 4.3
SH2D3C-204ENST00000414380 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.89■■■■■ 4.3
SH2D3C-204ENST00000414380 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.88■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.87■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 ERBINQ96RT1 1412 aa41.87■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.87■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.86■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.85■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 ADGRL2O95490 1459 aa41.82■■■■■ 4.29
SH2D3C-204ENST00000414380 CEP152O94986 1710 aa41.81■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 ABCC3O15438 1527 aa41.81■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 PZPP20742 1482 aa41.79■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 NCOA1Q15788 1441 aa41.79■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
SH2D3C-204ENST00000414380 DEPDC5O75140 1603 aa41.75■■■■■ 4.27
SH2D3C-204ENST00000414380 STRCQ7RTU9 1775 aa41.74■■■■■ 4.27
SH2D3C-204ENST00000414380 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
SH2D3C-204ENST00000414380 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.72■■■■■ 4.27
SH2D3C-204ENST00000414380 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
SH2D3C-204ENST00000414380 TNRQ92752 1358 aa41.65■■■■■ 4.26
SH2D3C-204ENST00000414380 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.6■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.58■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 KANK1Q14678 1352 aa41.57■■■■■ 4.25
SH2D3C-204ENST00000414380 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.56■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 ROCK1Q13464 1354 aa41.54■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 ITGAEP38570 1179 aa41.54■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.54■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 ERVK-7P63135 1459 aa41.53■■■■■ 4.24
SH2D3C-204ENST00000414380 PLA2R1Q13018 1463 aa41.49■■■■■ 4.23
SH2D3C-204ENST00000414380 NLRP1Q9C000 1473 aa41.49■■■■■ 4.23
SH2D3C-204ENST00000414380 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.49■■■■■ 4.23
SH2D3C-204ENST00000414380 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.48■■■■■ 4.23
SH2D3C-204ENST00000414380 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.47■■■■■ 4.23
SH2D3C-204ENST00000414380 PTPRTO14522 1441 aa41.44■■■■■ 4.22
SH2D3C-204ENST00000414380 UNC13BO14795 1591 aa41.42■■■■■ 4.22
SH2D3C-204ENST00000414380 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.4■■■■■ 4.22
SH2D3C-204ENST00000414380 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.39■■■■■ 4.22
SH2D3C-204ENST00000414380 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.38■■■■■ 4.21
SH2D3C-204ENST00000414380 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
SH2D3C-204ENST00000414380 PKD2Q13563 968 aa41.33■■■■■ 4.21
SH2D3C-204ENST00000414380 TET3O43151 1660 aa41.33■■■■■ 4.21
SH2D3C-204ENST00000414380 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.3■■■■■ 4.2
SH2D3C-204ENST00000414380 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.29■■■■■ 4.2
SH2D3C-204ENST00000414380 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
SH2D3C-204ENST00000414380 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.26■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 SYNMO15061 1565 aa41.24■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.24■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 PIK3C2BO00750 1634 aa41.22■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
SH2D3C-204ENST00000414380 NOS1P29475 1434 aa41.18■■■■■ 4.18
SH2D3C-204ENST00000414380 E9PCH4 1651 aa41.16■■■■■ 4.18
SH2D3C-204ENST00000414380 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.14■■■■■ 4.18
SH2D3C-204ENST00000414380 CERKQ8TCT0 537 aa41.14■■■■■ 4.18
SH2D3C-204ENST00000414380 NAIPQ13075 1403 aa41.13■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 NUP155O75694 1391 aa41.12■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.11■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 FBXO41Q8TF61 875 aa41.08■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 IQGAP1P46940 1657 aa41.07■■■■■ 4.17
SH2D3C-204ENST00000414380 MED14O60244 1454 aa41.06■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 SLIT1O75093 1534 aa41.05■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 HFM1A2PYH4 1435 aa41.05■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 ADGRB3O60242 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 IDI1Q13907 227 aa41.04■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.03■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.03■■■■■ 4.16
SH2D3C-204ENST00000414380 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SH2D3C-204ENST00000414380 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.98■■■■■ 4.15
SH2D3C-204ENST00000414380 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.97■■■■■ 4.15
SH2D3C-204ENST00000414380 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.94■■■■■ 4.14
SH2D3C-204ENST00000414380 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.91■■■■■ 4.14
SH2D3C-204ENST00000414380 LTKP29376 864 aa40.9■■■■■ 4.14
SH2D3C-204ENST00000414380 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.89■■■■■ 4.14
SH2D3C-204ENST00000414380 EID1Q9Y6B2 187 aa40.89■■■■■ 4.14
SH2D3C-204ENST00000414380 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.88■■■■■ 4.13
SH2D3C-204ENST00000414380 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
SH2D3C-204ENST00000414380 TRIM52Q96A61 297 aa40.81■■■■■ 4.12
SH2D3C-204ENST00000414380 CPS1P31327 1500 aa40.8■■■■■ 4.12
SH2D3C-204ENST00000414380 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
SH2D3C-204ENST00000414380 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.76■■■■■ 4.12
SH2D3C-204ENST00000414380 ZFYVE9O95405 1425 aa40.73■■■■■ 4.11
SH2D3C-204ENST00000414380 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.71■■■■■ 4.11
SH2D3C-204ENST00000414380 TRPM2O94759 1503 aa40.7■■■■■ 4.11
SH2D3C-204ENST00000414380 CLTCL1P53675 1640 aa40.67■■■■■ 4.1
SH2D3C-204ENST00000414380 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
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