RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 E2F4Q16254 413 aa6.9□□□□□ -1.3
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MFRPQ9BY79 579 aa6.9□□□□□ -1.3
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.9□□□□□ -1.3
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.88□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP1R37O75864 691 aa6.87□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.87□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.85□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AK7Q96M32 723 aa6.85□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.84□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WNT2BQ93097 391 aa6.84□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNH8Q96L42 1107 aa6.84□□□□□ -1.31
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL27Q8NEV9 243 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MFSD10Q14728 455 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNK17Q96T54 332 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM66O15016 1216 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAMK2BQ13554 666 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC34A2O95436 690 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDE4DQ08499 809 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STK17AQ9UEE5 414 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NECTIN2Q92692 538 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C2orf72A6NCS6 295 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SOX12O15370 315 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNC4Q03721 635 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TREML4Q6UXN2 200 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM117AQ9C073 453 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR37O15354 613 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NLRP6P59044 892 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARID3AQ99856 593 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARID3CA6NKF2 412 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF3CO14782 793 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDE4AP27815 886 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APBB1O00213 710 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A6NJR5 290 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FLIIQ13045 1269 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOPCQ9HD26 462 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAK2O60296 914 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NBPF3Q9H094 633 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMHR2Q16671 573 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTECB2RU33 542 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMC2Q8TDI7 906 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDIA6Q15084 440 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRF6O14896 467 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCAMP50895 628 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP2K5Q13163 448 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC102AQ96A19 550 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WFS1O76024 890 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DPYSL4O14531 572 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPREP23469 700 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MCM6Q14566 821 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PKDCCQ504Y2 493 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.55□□□□□ -1.36
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