RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409040.1

EML4-205, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EML4, Length 962 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML4-205ENST00000409040 TIAM1Q13009 1591 aa26.99■■□□□ 1.91
EML4-205ENST00000409040 TSPY4P0CV99 314 aa26.97■■□□□ 1.91
EML4-205ENST00000409040 TSPY10P0CW01 314 aa26.97■■□□□ 1.91
EML4-205ENST00000409040 TNRQ92752 1358 aa26.96■■□□□ 1.91
EML4-205ENST00000409040 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.93■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.93■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 TOM1O60784 492 aa26.92■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
EML4-205ENST00000409040 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.88■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.88■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 PZPP20742 1482 aa26.87■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 NCOA2Q15596 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 PIP4K2BP78356 416 aa26.87■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.87■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 MIA2Q96PC5 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 CPS1P31327 1500 aa26.83■■□□□ 1.89
EML4-205ENST00000409040 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.881e-7■□□□□ 8.3
EML4-205ENST00000409040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.81■■□□□ 1.88
EML4-205ENST00000409040 NLRP1Q9C000 1473 aa26.81■■□□□ 1.88
EML4-205ENST00000409040 HSPA1LP34931 641 aa26.78■■□□□ 1.88
EML4-205ENST00000409040 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
EML4-205ENST00000409040 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.76■■□□□ 1.87
EML4-205ENST00000409040 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.75■■□□□ 1.87
EML4-205ENST00000409040 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
EML4-205ENST00000409040 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.72■■□□□ 1.87
EML4-205ENST00000409040 MED14O60244 1454 aa26.68■■□□□ 1.86
EML4-205ENST00000409040 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.67■■□□□ 1.86
EML4-205ENST00000409040 DEPDC5O75140 1603 aa26.66■■□□□ 1.86
EML4-205ENST00000409040 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
EML4-205ENST00000409040 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.64■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 ABCC3O15438 1527 aa26.62■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.6■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.6■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 ERVK-7P63135 1459 aa26.59■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 IQGAP1P46940 1657 aa26.59■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 APLP2Q06481 763 aa26.58■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 EID1Q9Y6B2 187 aa26.58■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
EML4-205ENST00000409040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.56■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.55■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.55■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.54■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 MAP3K1Q13233 1512 aa26.53■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.848e-24■□□□□ 9.4
EML4-205ENST00000409040 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.52■■□□□ 1.84
EML4-205ENST00000409040 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.51■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 KANK1Q14678 1352 aa26.5■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 KIF15Q9NS87 1388 aa26.5■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 LTKP29376 864 aa26.47■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 SYNMO15061 1565 aa26.46■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.46■■□□□ 1.83
EML4-205ENST00000409040 ERBINQ96RT1 1412 aa26.45■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 CEP152O94986 1710 aa26.45■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.44■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.44■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 ALKQ9UM73 1620 aa26.41■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 SLIT1O75093 1534 aa26.4■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.4■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.4■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 ABCC5O15440 1437 aa26.39■■□□□ 1.82
EML4-205ENST00000409040 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.38■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.37■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.36■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 BCANQ96GW7 911 aa26.35■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 DAPK1P53355 1430 aa26.34■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 IDI1Q13907 227 aa26.34■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.34■■□□□ 1.81
EML4-205ENST00000409040 KCNA6P17658 529 aa26.32■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 PIK3C2BO00750 1634 aa26.29■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.29■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.29■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.28■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.28■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.28■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.28■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 TMEM94Q12767 1356 aa26.27■■□□□ 1.8
EML4-205ENST00000409040 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
EML4-205ENST00000409040 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
EML4-205ENST00000409040 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 MSH6P52701 1360 aa26.18■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 NOS1P29475 1434 aa26.17■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
EML4-205ENST00000409040 SLAIN2Q9P270 581 aa26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms