RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402876.3

PARVB-202, Transcript of parvin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PARVB, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVB-202ENST00000402876 PZPP20742 1482 aa28.54■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.53■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 NUP155O75694 1391 aa28.52■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.51■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.51■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 REREQ9P2R6 1566 aa28.49■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.48■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 ATP10AO60312 1499 aa28.46■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PARVB-202ENST00000402876 KIF3BO15066 747 aa28.44■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.43■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 KANK1Q14678 1352 aa28.42■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.41■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PARVB-202ENST00000402876 TET3O43151 1660 aa28.38■■■□□ 2.13
PARVB-202ENST00000402876 AGLP35573 1532 aa28.37■■■□□ 2.13
PARVB-202ENST00000402876 PKD2Q13563 968 aa28.35■■■□□ 2.13
PARVB-202ENST00000402876 CEP152O94986 1710 aa28.34■■■□□ 2.13
PARVB-202ENST00000402876 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.3■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 E9PCH4 1651 aa28.29■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.29■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.29■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 FOXD1Q16676 465 aa28.28■■■□□ 2.12
PARVB-202ENST00000402876 GGT6Q6P531 493 aa28.26■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.25■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.25■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 ABCC3O15438 1527 aa28.23■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.23■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 NEUROD1Q13562 356 aa28.22■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.21■■■□□ 2.11
PARVB-202ENST00000402876 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.19■■■□□ 2.1
PARVB-202ENST00000402876 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PARVB-202ENST00000402876 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.17■■■□□ 2.1
PARVB-202ENST00000402876 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.16■■■□□ 2.1
PARVB-202ENST00000402876 TONSLQ96HA7 1378 aa28.14■■■□□ 2.1
PARVB-202ENST00000402876 TRPM2O94759 1503 aa28.13■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.1■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 PLA2R1Q13018 1463 aa28.1■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 PTPRTO14522 1441 aa28.09■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.09■■■□□ 2.09
PARVB-202ENST00000402876 NPATQ14207 1427 aa28.07■■■□□ 2.08
PARVB-202ENST00000402876 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PARVB-202ENST00000402876 MLECQ14165 292 aa28.03■■■□□ 2.08
PARVB-202ENST00000402876 CLTCL1P53675 1640 aa28.03■■■□□ 2.08
PARVB-202ENST00000402876 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.02■■■□□ 2.08
PARVB-202ENST00000402876 MROH2AA6NES4 1674 aa28.01■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.01■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 KIF1BO60333 1816 aa27.99■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.99■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 NOS1P29475 1434 aa27.96■■■□□ 2.07
PARVB-202ENST00000402876 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 SYNMO15061 1565 aa27.93■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.93■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 PIK3C2BO00750 1634 aa27.92■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.92■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.9■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 ERVK-7P63135 1459 aa27.9■■■□□ 2.06
PARVB-202ENST00000402876 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.89■■■□□ 2.05
PARVB-202ENST00000402876 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.87■■■□□ 2.05
PARVB-202ENST00000402876 ZMYM3Q14202 1370 aa27.86■■■□□ 2.05
PARVB-202ENST00000402876 C3P01024 1663 aa27.83■■■□□ 2.05
PARVB-202ENST00000402876 ADGRB3O60242 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.82■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 MADDQ8WXG6 1647 aa27.81■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.8■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 RGL3Q3MIN7 710 aa27.79■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 IFT172Q9UG01 1749 aa27.78■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.76■■■□□ 2.04
PARVB-202ENST00000402876 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.76■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.74■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.73■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 STAC3Q96MF2 364 aa27.73■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.73■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 PPLO60437 1756 aa27.73■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 IDI1Q13907 227 aa27.71■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 TNRQ92752 1358 aa27.71■■■□□ 2.03
PARVB-202ENST00000402876 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.7■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.68■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 MYOM2P54296 1465 aa27.68■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.67■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.67■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.66■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.65■■■□□ 2.02
PARVB-202ENST00000402876 NLRP1Q9C000 1473 aa27.64■■■□□ 2.01
PARVB-202ENST00000402876 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.62■■■□□ 2.01
PARVB-202ENST00000402876 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PARVB-202ENST00000402876 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.61■■■□□ 2.01
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