RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
C20orf27-204ENST00000399683 MADDQ8WXG6 1647 aa24.82■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 MROH2AA6NES4 1674 aa24.8■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 CEP152O94986 1710 aa24.79■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
C20orf27-204ENST00000399683 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.76■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 KIF3BO15066 747 aa24.75■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.75■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.72■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.71■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 ABCC3O15438 1527 aa24.71■■□□□ 1.55
C20orf27-204ENST00000399683 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.69■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 TET3O43151 1660 aa24.69■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.69■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 C3P01024 1663 aa24.69■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.68■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 MLECQ14165 292 aa24.67■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 GGT6Q6P531 493 aa24.66■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 KANK1Q14678 1352 aa24.66■■□□□ 1.54
C20orf27-204ENST00000399683 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.63■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.63■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 E9PCH4 1651 aa24.59■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 PTPRMP28827 1452 aa24.58■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.58■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
C20orf27-204ENST00000399683 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.57■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.57■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 NUP155O75694 1391 aa24.56■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 PZPP20742 1482 aa24.56■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.55■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 HRCP23327 699 aa24.55■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.52■■□□□ 1.52
C20orf27-204ENST00000399683 ZMYM3Q14202 1370 aa24.51■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.5■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 NPATQ14207 1427 aa24.49■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 TRIM52Q96A61 297 aa24.46■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.46■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 ERVK-7P63135 1459 aa24.45■■□□□ 1.51
C20orf27-204ENST00000399683 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.45■■□□□ 1.5
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
C20orf27-204ENST00000399683 SYNMO15061 1565 aa24.42■■□□□ 1.5
C20orf27-204ENST00000399683 PIK3C2BO00750 1634 aa24.4■■□□□ 1.5
C20orf27-204ENST00000399683 NOS1P29475 1434 aa24.4■■□□□ 1.5
C20orf27-204ENST00000399683 TRPM2O94759 1503 aa24.39■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.36■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 PTPRTO14522 1441 aa24.35■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 TNRQ92752 1358 aa24.34■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 NLRP1Q9C000 1473 aa24.33■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 PKD2Q13563 968 aa24.33■■□□□ 1.49
C20orf27-204ENST00000399683 KIF1BO60333 1816 aa24.33■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 CLTCL1P53675 1640 aa24.32■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.31■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.31■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.29■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.28■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 PLA2R1Q13018 1463 aa24.28■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.28■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.27■■□□□ 1.48
C20orf27-204ENST00000399683 ADGRB3O60242 1522 aa24.26■■□□□ 1.47
C20orf27-204ENST00000399683 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
C20orf27-204ENST00000399683 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.24■■□□□ 1.47
C20orf27-204ENST00000399683 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.24■■□□□ 1.47
C20orf27-204ENST00000399683 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.21■■□□□ 1.47
C20orf27-204ENST00000399683 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.2■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 FOXD1Q16676 465 aa24.2■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.2■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.18■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
C20orf27-204ENST00000399683 IDI1Q13907 227 aa24.14■■□□□ 1.45
C20orf27-204ENST00000399683 IFT172Q9UG01 1749 aa24.14■■□□□ 1.45
C20orf27-204ENST00000399683 PPLO60437 1756 aa24.11■■□□□ 1.45
C20orf27-204ENST00000399683 SLIT1O75093 1534 aa24.11■■□□□ 1.45
C20orf27-204ENST00000399683 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.09■■□□□ 1.45
C20orf27-204ENST00000399683 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.08■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 STRCQ7RTU9 1775 aa24.07■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.05■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.03■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.03■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.03■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 ZFYVE9O95405 1425 aa24.02■■□□□ 1.44
C20orf27-204ENST00000399683 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
C20orf27-204ENST00000399683 IQGAP1P46940 1657 aa23.99■■□□□ 1.43
C20orf27-204ENST00000399683 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
C20orf27-204ENST00000399683 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.1 ms