RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397835.4

C5orf38-202, Transcript of chromosome 5 open reading frame 38, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C5orf38, Length 681 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38-202ENST00000397835 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ADGRL2O95490 1459 aa36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 NCOA1Q15788 1441 aa36.41■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 PTPRKQ15262 1439 aa36.4■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ERBINQ96RT1 1412 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.38■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.36■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 NPATQ14207 1427 aa36.34■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.34■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 HSPA2P54652 639 aa36.33■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.32■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 ABCC3O15438 1527 aa36.29■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 PZPP20742 1482 aa36.24■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ITGAEP38570 1179 aa36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 DEPDC5O75140 1603 aa36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ROCK1Q13464 1354 aa36.21■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.19■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 CEP152O94986 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.16■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.12■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 TNRQ92752 1358 aa36.11■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 KANK1Q14678 1352 aa36.09■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.05■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 ERVK-7P63135 1459 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 STRCQ7RTU9 1775 aa36■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 UNC13BO14795 1591 aa35.98■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 NLRP1Q9C000 1473 aa35.95■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.94■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 NAIPQ13075 1403 aa35.9■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 PLA2R1Q13018 1463 aa35.89■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 TET3O43151 1660 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 HFM1A2PYH4 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.82■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 PTPRTO14522 1441 aa35.82■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 NUP155O75694 1391 aa35.81■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 NOS1P29475 1434 aa35.81■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 SYNMO15061 1565 aa35.78■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 FBXO41Q8TF61 875 aa35.77■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 PKD2Q13563 968 aa35.76■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.71■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 E9PCH4 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 PIK3C2BO00750 1634 aa35.7■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 IDI1Q13907 227 aa35.68■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.68■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.64■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.61■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.6■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 ADGRB3O60242 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 SLIT1O75093 1534 aa35.58■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 MED14O60244 1454 aa35.57■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.56■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 TRIM52Q96A61 297 aa35.55■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.53■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.52■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 LTKP29376 864 aa35.51■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 CERKQ8TCT0 537 aa35.5■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.48■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 IQGAP1P46940 1657 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 EID1Q9Y6B2 187 aa35.43■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.39■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 TRPM2O94759 1503 aa35.38■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 ZFYVE9O95405 1425 aa35.37■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.36■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.34■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 CLTCL1P53675 1640 aa35.33■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 FOXD1Q16676 465 aa35.29■■■■□ 3.24
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