RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.67■■□□□ 1.86
UPP1-202ENST00000395560 A2MP01023 1474 aa26.67■■□□□ 1.86
UPP1-202ENST00000395560 ATP10AO60312 1499 aa26.66■■□□□ 1.86
UPP1-202ENST00000395560 REREQ9P2R6 1566 aa26.64■■□□□ 1.86
UPP1-202ENST00000395560 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.62■■□□□ 1.85
UPP1-202ENST00000395560 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UPP1-202ENST00000395560 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.59■■□□□ 1.85
UPP1-202ENST00000395560 MLECQ14165 292 aa26.58■■□□□ 1.85
UPP1-202ENST00000395560 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.57■■□□□ 1.84
UPP1-202ENST00000395560 AGLP35573 1532 aa26.55■■□□□ 1.84
UPP1-202ENST00000395560 HSPA2P54652 639 aa26.53■■□□□ 1.84
UPP1-202ENST00000395560 KIF3BO15066 747 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-202ENST00000395560 DEPDC5O75140 1603 aa26.48■■□□□ 1.83
UPP1-202ENST00000395560 UNC13BO14795 1591 aa26.48■■□□□ 1.83
UPP1-202ENST00000395560 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
UPP1-202ENST00000395560 TRIM52Q96A61 297 aa26.45■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.43■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 KANK1Q14678 1352 aa26.43■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.42■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 NUP155O75694 1391 aa26.42■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 GGT6Q6P531 493 aa26.39■■□□□ 1.82
UPP1-202ENST00000395560 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.39■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.38■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.38■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 FBXO41Q8TF61 875 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.34■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-202ENST00000395560 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 PZPP20742 1482 aa26.32■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.32■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 C3P01024 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 TET3O43151 1660 aa26.28■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 ABCC3O15438 1527 aa26.27■■□□□ 1.8
UPP1-202ENST00000395560 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 STRCQ7RTU9 1775 aa26.25■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 CEP152O94986 1710 aa26.25■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.23■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 PKD2Q13563 968 aa26.22■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
UPP1-202ENST00000395560 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 MROH2AA6NES4 1674 aa26.17■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 E9PCH4 1651 aa26.16■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.15■■□□□ 1.78
UPP1-202ENST00000395560 CERKQ8TCT0 537 aa26.12■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 NPATQ14207 1427 aa26.12■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 ZMYM3Q14202 1370 aa26.11■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.09■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 FOXD1Q16676 465 aa26.09■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 PTPRTO14522 1441 aa26.08■■□□□ 1.77
UPP1-202ENST00000395560 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.06■■□□□ 1.76
UPP1-202ENST00000395560 NOS1P29475 1434 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-202ENST00000395560 TRPM2O94759 1503 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-202ENST00000395560 PLA2R1Q13018 1463 aa26.01■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 ERVK-7P63135 1459 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.99■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.97■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.96■■□□□ 1.75
UPP1-202ENST00000395560 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.95■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 SYNMO15061 1565 aa25.94■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.92■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 PIK3C2BO00750 1634 aa25.92■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 TNRQ92752 1358 aa25.91■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 CLTCL1P53675 1640 aa25.9■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 NEUROD1Q13562 356 aa25.89■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.89■■□□□ 1.74
UPP1-202ENST00000395560 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.87■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 KIF1BO60333 1816 aa25.86■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.86■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 NLRP1Q9C000 1473 aa25.85■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 IDI1Q13907 227 aa25.85■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.84■■□□□ 1.73
UPP1-202ENST00000395560 TONSLQ96HA7 1378 aa25.82■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.8■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 ADGRB3O60242 1522 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.77■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.77■■□□□ 1.72
UPP1-202ENST00000395560 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UPP1-202ENST00000395560 STAC3Q96MF2 364 aa25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms