RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 ATP10AO60312 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
UBXN6-202ENST00000394765 UNC13BO14795 1591 aa26.29■■□□□ 1.8
UBXN6-202ENST00000394765 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.28■■□□□ 1.8
UBXN6-202ENST00000394765 GGT6Q6P531 493 aa26.28■■□□□ 1.8
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.27■■□□□ 1.8
UBXN6-202ENST00000394765 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 PKD2Q13563 968 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 DEPDC5O75140 1603 aa26.23■■□□□ 1.79
UBXN6-202ENST00000394765 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 MLECQ14165 292 aa26.18■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 NEUROD1Q13562 356 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 REREQ9P2R6 1566 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN6-202ENST00000394765 KANK1Q14678 1352 aa26.13■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 AGLP35573 1532 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 CEP152O94986 1710 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC3O15438 1527 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN6-202ENST00000394765 PLA2R1Q13018 1463 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN6-202ENST00000394765 E9PCH4 1651 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN6-202ENST00000394765 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN6-202ENST00000394765 TET3O43151 1660 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN6-202ENST00000394765 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
UBXN6-202ENST00000394765 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26■■□□□ 1.75
UBXN6-202ENST00000394765 NPATQ14207 1427 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN6-202ENST00000394765 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN6-202ENST00000394765 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 PTPRTO14522 1441 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN6-202ENST00000394765 TONSLQ96HA7 1378 aa25.89■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 TRPM2O94759 1503 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 ZMYM3Q14202 1370 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.84■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 CLTCL1P53675 1640 aa25.83■■□□□ 1.73
UBXN6-202ENST00000394765 NOS1P29475 1434 aa25.82■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 RGL3Q3MIN7 710 aa25.82■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 SYNMO15061 1565 aa25.8■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.78■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 ERVK-7P63135 1459 aa25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-202ENST00000394765 MADDQ8WXG6 1647 aa25.76■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.75■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 IDI1Q13907 227 aa25.74■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.74■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.72■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.71■■□□□ 1.71
UBXN6-202ENST00000394765 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.7■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.69■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.69■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 PIK3C2BO00750 1634 aa25.68■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 MROH2AA6NES4 1674 aa25.68■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 C3P01024 1663 aa25.68■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.65■■□□□ 1.7
UBXN6-202ENST00000394765 TNRQ92752 1358 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-202ENST00000394765 ADGRB3O60242 1522 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-202ENST00000394765 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-202ENST00000394765 KIF1BO60333 1816 aa25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-202ENST00000394765 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.56■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.56■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 PTPRMP28827 1452 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.51■■□□□ 1.68
UBXN6-202ENST00000394765 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-202ENST00000394765 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-202ENST00000394765 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-202ENST00000394765 IFT172Q9UG01 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
UBXN6-202ENST00000394765 NLRP1Q9C000 1473 aa25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms