RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 FOXD1Q16676 465 aa34.2■■■■□ 3.07
CNN3-202ENST00000394202 UNC13BO14795 1591 aa34.2■■■■□ 3.07
CNN3-202ENST00000394202 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.18■■■■□ 3.06
CNN3-202ENST00000394202 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.17■■■■□ 3.06
CNN3-202ENST00000394202 ATP10AO60312 1499 aa34.16■■■■□ 3.06
CNN3-202ENST00000394202 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CNN3-202ENST00000394202 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.13■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 PKD2Q13563 968 aa34.12■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 DEPDC5O75140 1603 aa34.11■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.1■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.1■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.09■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 GGT6Q6P531 493 aa34.08■■■■□ 3.05
CNN3-202ENST00000394202 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.07■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.05■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.04■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 REREQ9P2R6 1566 aa34.02■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.02■■■■□ 3.04
CNN3-202ENST00000394202 NEUROD1Q13562 356 aa34■■■■□ 3.03
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34■■■■□ 3.03
CNN3-202ENST00000394202 KANK1Q14678 1352 aa33.99■■■■□ 3.03
CNN3-202ENST00000394202 AGLP35573 1532 aa33.96■■■■□ 3.03
CNN3-202ENST00000394202 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.9■■■■□ 3.02
CNN3-202ENST00000394202 MLECQ14165 292 aa33.89■■■■□ 3.02
CNN3-202ENST00000394202 CEP152O94986 1710 aa33.87■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 TET3O43151 1660 aa33.86■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 ABCC3O15438 1527 aa33.86■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 E9PCH4 1651 aa33.85■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.85■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 PLA2R1Q13018 1463 aa33.85■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.8■■■■□ 3
CNN3-202ENST00000394202 NPATQ14207 1427 aa33.76■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.73■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.72■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 PTPRTO14522 1441 aa33.72■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
CNN3-202ENST00000394202 TONSLQ96HA7 1378 aa33.69■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.67■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.67■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.65■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.65■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 TRPM2O94759 1503 aa33.64■■■□□ 2.98
CNN3-202ENST00000394202 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.63■■■□□ 2.97
CNN3-202ENST00000394202 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
CNN3-202ENST00000394202 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.59■■■□□ 2.97
CNN3-202ENST00000394202 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
CNN3-202ENST00000394202 NOS1P29475 1434 aa33.57■■■□□ 2.96
CNN3-202ENST00000394202 CLTCL1P53675 1640 aa33.56■■■□□ 2.96
CNN3-202ENST00000394202 ZMYM3Q14202 1370 aa33.56■■■□□ 2.96
CNN3-202ENST00000394202 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.52■■■□□ 2.96
CNN3-202ENST00000394202 RGL3Q3MIN7 710 aa33.52■■■□□ 2.96
CNN3-202ENST00000394202 SYNMO15061 1565 aa33.5■■■□□ 2.95
CNN3-202ENST00000394202 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.48■■■□□ 2.95
CNN3-202ENST00000394202 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.48■■■□□ 2.95
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-7P63135 1459 aa33.47■■■□□ 2.95
CNN3-202ENST00000394202 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 IDI1Q13907 227 aa33.43■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.42■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.41■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.4■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 PIK3C2BO00750 1634 aa33.39■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.39■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.39■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 MROH2AA6NES4 1674 aa33.39■■■□□ 2.94
CNN3-202ENST00000394202 MADDQ8WXG6 1647 aa33.37■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.37■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.36■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.34■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 KIF1BO60333 1816 aa33.33■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
CNN3-202ENST00000394202 C3P01024 1663 aa33.32■■■□□ 2.92
CNN3-202ENST00000394202 ADGRB3O60242 1522 aa33.31■■■□□ 2.92
CNN3-202ENST00000394202 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.28■■■□□ 2.92
CNN3-202ENST00000394202 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
CNN3-202ENST00000394202 TNRQ92752 1358 aa33.28■■■□□ 2.92
CNN3-202ENST00000394202 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.25■■■□□ 2.91
CNN3-202ENST00000394202 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.21■■■□□ 2.91
CNN3-202ENST00000394202 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.2■■■□□ 2.91
CNN3-202ENST00000394202 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.17■■■□□ 2.9
CNN3-202ENST00000394202 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.17■■■□□ 2.9
CNN3-202ENST00000394202 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
CNN3-202ENST00000394202 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.15■■■□□ 2.9
CNN3-202ENST00000394202 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.14■■■□□ 2.9
CNN3-202ENST00000394202 IFT172Q9UG01 1749 aa33.12■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.12■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 STAC3Q96MF2 364 aa33.11■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.1■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 PTPRMP28827 1452 aa33.09■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 PPLO60437 1756 aa33.09■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 MYOM2P54296 1465 aa33.09■■■□□ 2.89
CNN3-202ENST00000394202 NLRP1Q9C000 1473 aa33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms