RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 GGT6Q6P531 493 aa25.47■■□□□ 1.67
NME1-NME2-202ENST00000393193 STRCQ7RTU9 1775 aa25.46■■□□□ 1.67
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF3BO15066 747 aa25.45■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA2P54652 639 aa25.45■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.45■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRL2O95490 1459 aa25.44■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.44■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEPDC5O75140 1603 aa25.43■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC3O15438 1527 aa25.41■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF15Q9NS87 1388 aa25.41■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERBINQ96RT1 1412 aa25.4■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCOA1Q15788 1441 aa25.39■■□□□ 1.66
NME1-NME2-202ENST00000393193 PZPP20742 1482 aa25.39■■□□□ 1.65
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP152O94986 1710 aa25.38■■□□□ 1.65
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.34■■□□□ 1.65
NME1-NME2-202ENST00000393193 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.33■■□□□ 1.65
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.31■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.645e-11■■■■■ 54.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.3■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.29■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.29■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.27■■□□□ 1.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.26■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.25■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLA2R1Q13018 1463 aa25.24■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNRQ92752 1358 aa25.24■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.23■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERVK-7P63135 1459 aa25.22■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 ROCK1Q13464 1354 aa25.21■■□□□ 1.63
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRTO14522 1441 aa25.2■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.2■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNC13BO14795 1591 aa25.19■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP1Q9C000 1473 aa25.19■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.15■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.13■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.12■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 TET3O43151 1660 aa25.1■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.1■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.09■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYNMO15061 1565 aa25.09■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.08■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.08■■□□□ 1.61
NME1-NME2-202ENST00000393193 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.08■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 KANK1Q14678 1352 aa25.07■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOS1P29475 1434 aa25.06■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.65e-8■■□□□ 12.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.05■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIK3C2BO00750 1634 aa25.04■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 PKD2Q13563 968 aa25.03■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 E9PCH4 1651 aa25.02■■□□□ 1.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 MED14O60244 1454 aa25.01■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLIT1O75093 1534 aa24.98■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 NAIPQ13075 1403 aa24.97■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITGAEP38570 1179 aa24.96■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 CERKQ8TCT0 537 aa24.95■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 IQGAP1P46940 1657 aa24.94■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO41Q8TF61 875 aa24.92■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRB3O60242 1522 aa24.91■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.91■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 HFM1A2PYH4 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 IDI1Q13907 227 aa24.88■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.88■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP155O75694 1391 aa24.87■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.86■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.86■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.84■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.83■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.83■■□□□ 1.57
NME1-NME2-202ENST00000393193 LTKP29376 864 aa24.82■■□□□ 1.56
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFYVE9O95405 1425 aa24.78■■□□□ 1.56
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPS1P31327 1500 aa24.77■■□□□ 1.56
NME1-NME2-202ENST00000393193 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.72■■□□□ 1.55
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPM2O94759 1503 aa24.71■■□□□ 1.55
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLTCL1P53675 1640 aa24.7■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALKQ9UM73 1620 aa24.67■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.66■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 EID1Q9Y6B2 187 aa24.66■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.66■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms